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Enregistrement W3036855997 · doi:10.1158/1078-0432.ccr-20-1024

Population-based Screening for <i>BRAF</i> V600E in Metastatic Colorectal Cancer Reveals Increased Prevalence and Poor Prognosis

2020· article· en· W3036855997 sur OpenAlexaff
Jenny E. Chu, Benny Johnson, Laveniya Kugathasan, Van K. Morris, Kanwal Raghav, Lucas Swanson, Howard J. Lim, Daniel J. Renouf, Sharlene Gill, Robert Wolber, Aly Karsan, Scott Kopetz, David F. Schaeffer, Jonathan M. Loree

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueColorectal Cancer Treatments and Studies
Établissements canadiensSpinal Cord Injury BCVancouver Coastal Health
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésMedicineInternal medicineColorectal cancerCohortOncologyPopulationCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Purpose: BRAF V600E mutations portend poor prognosis in metastatic colorectal cancer (mCRC); however, the true prevalence and prognosis are unknown, as unwell patients may not undergo BRAF sequencing. Experimental Design: We reviewed a population-based cohort of 1,898 patients with colorectal cancer that underwent reflexive IHC mismatch repair (MMR) and BRAFV600E testing. Outcomes among IHC-detected BRAFV600E mCRC (BRAFIHC) were compared with patients with next-generation sequencing (NGS)–identified BRAFV600E-mutated mCRC from two institutions (BRAFNGS) with patients spanning from 2004 to 2018. Results: All-stage population prevalence of BRAFV600E was 12.5% (238/1,898) and did not differ between early and metastatic stages (P = 0.094). Prevalence among mCRC was 10.6% (61/575), of whom 51 (83.6%) were referred to oncology and 26 (42.6%) had NGS testing. BRAFIHC had worse median overall survival (mOS) than BRAFNGS [5.5 vs. 20.4 months; HR, 2.90; 95% confidence interval (CI), 1.89–4.45; P &amp;lt; 0.0001], which persisted in multivariate analysis (P &amp;lt; 0.0001). Across a combined NGS and IHC cohort, BRAFV600E tumors with deficient MMR showed worse mOS compared with MMR proficient tumors (8.9 vs. 17.2 months; HR, 1.46; 95% CI, 0.96–2.27; P = 0.043). In this combined cohort, first-line progression-free survival was 5.9 months, with minimal differences between regimens. Within the population-based cohort, attrition between treatment lines was high with only 60.7% receiving first-line chemotherapy and 26.2% receiving second line. Conclusions: Patients with BRAFV600E-mutated mCRC have a worse prognosis than previously suggested, potentially arising from referral bias for testing. High attrition between lines of therapy suggests efficacious therapies need to be prioritized early for patients to benefit.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,641

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,289
Tête enseignante GPT0,520
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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