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Enregistrement W3036900251 · doi:10.1073/pnas.2002328117

Pseudouridylation defect due to <i>DKC1</i> and <i>NOP10</i> mutations causes nephrotic syndrome with cataracts, hearing impairment, and enterocolitis

2020· article· en· W3036900251 sur OpenAlexaff
Eszter Balogh, Jennifer C. Chandler, Máté Varga, Mona Tahoun, Dóra K. Menyhárd, Gusztáv Schay, Tomas Goncalves, Renáta Hamar, Regina Légrádi, Ákos Szekeres, Olivier Gribouval, Robert Kleta, Horia Stanescu, Detlef Böckenhauer, Andrea Kerti, Hywel Williams, Veronica A. Kinsler, Wei‐Li Di, David Curtis, Maria Kolatsi‐Joannou, Hafsa Hammid, Anna Szőcs, Kristóf Perczel, Erika Maka, Gergely Toldi, Florentina Sava, Christelle Arrondel, Magdolna Kardos, Attila Fintha, Ahmed Hossain, Felipe D’Arco, Marios Kaliakatsos, Jutta Köeglmeier, William Mifsud, Mariya Moosajee, Ana Faro, Eszter Jávorszky, Gábor Rudas, Marwa H. Saied, Salah Marzouk, Kata Kelen, Judit Götze, György Reusz, Tivadar Tulassay, François Dragon, Géraldine Mollet, Susanne Motameny, Hölger Thiele, Guillaume Dorval, Peter Nürnberg, András Perczel, Attila J. Szabó, David A. Long, Kazunori Tomita, Corinne Antignac, Aoife Waters, Kálmán Tory

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesKidney Research UKMedical Research CouncilNational Institute for Health and Care ResearchCancer Research UK
Mots-clésPseudouridineDyskeratosis congenitaSmall nucleolar RNABiologyTelomereGeneticsRNALong non-coding RNATransfer RNADNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

RNA modifications play a fundamental role in cellular function. Pseudouridylation, the most abundant RNA modification, is catalyzed by the H/ACA small ribonucleoprotein (snoRNP) complex that shares four core proteins, dyskerin (DKC1), NOP10, NHP2, and GAR1. Mutations in DKC1 , NOP10 , or NHP2 cause dyskeratosis congenita (DC), a disorder characterized by telomere attrition. Here, we report a phenotype comprising nephrotic syndrome, cataracts, sensorineural deafness, enterocolitis, and early lethality in two pedigrees: males with DKC1 p.Glu206Lys and two children with homozygous NOP10 p.Thr16Met. Females with heterozygous DKC1 p.Glu206Lys developed cataracts and sensorineural deafness, but nephrotic syndrome in only one case of skewed X-inactivation. We found telomere attrition in both pedigrees, but no mucocutaneous abnormalities suggestive of DC. Both mutations fall at the dyskerin–NOP10 binding interface in a region distinct from those implicated in DC, impair the dyskerin–NOP10 interaction, and disrupt the catalytic pseudouridylation site. Accordingly, we found reduced pseudouridine levels in the ribosomal RNA (rRNA) of the patients. Zebrafish dkc1 mutants recapitulate the human phenotype and show reduced 18S pseudouridylation, ribosomal dysregulation, and a cell-cycle defect in the absence of telomere attrition. We therefore propose that this human disorder is the consequence of defective snoRNP pseudouridylation and ribosomal dysfunction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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