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Enregistrement W3037249913 · doi:10.1038/s41597-020-0551-2

The BenBioDen database, a global database for meio-, macro- and megabenthic biomass and densities

2020· article· en· W3037249913 sur OpenAlexafffund
Tanja Stratmann, Dick van Oevelen, Pedro Martínez Arbizu, Chih‐Lin Wei, Jian-Xiang Liao, Mathieu Cusson, Ricardo A. Scrosati, Philippe Archambault, Paul V. R. Snelgrove, Patricia A. Ramey, Brenda J. Burd, Ellen Kenchington, Kent Gilkinson, Rénald Belley, Karline Soetaert

Notice bibliographique

RevueScientific Data · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine Biology and Ecology Research
Établissements canadiensBedford Institute of OceanographyFisheries and Oceans CanadaMemorial University of NewfoundlandUniversité LavalArcticNetSt. Francis Xavier UniversityUniversité du Québec à Chicoutimi
Organismes subventionnairesExecutive Agency for Small and Medium-sized EnterprisesUniversität RostockNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekEuropean CommissionArcticNet
Mots-clésBenthic zoneFaunaBiomass (ecology)DatabaseEnvironmental scienceBioturbationOceanographyEcosystemBenthosEcologyMacrobenthosAbundance (ecology)BiologyGeologyComputer scienceSedimentPaleontology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Benthic fauna refers to all fauna that live in or on the seafloor, which researchers typically divide into size classes meiobenthos (32/64 µm–0.5/1 mm), macrobenthos (250 µm–1 cm), and megabenthos (>1 cm). Benthic fauna play important roles in bioturbation activity, mineralization of organic matter, and in marine food webs. Evaluating their role in these ecosystem functions requires knowledge of their global distribution and biomass. We therefore established the BenBioDen database, the largest open-access database for marine benthic biomass and density data compiled so far. In total, it includes 11,792 georeferenced benthic biomass and 51,559 benthic density records from 384 and 600 studies, respectively. We selected all references following the procedure for systematic reviews and meta-analyses, and report biomass records as grams of wet mass, dry mass, or ash-free dry mass, or carbon per m 2 and as abundance records as individuals per m 2 . This database provides a point of reference for future studies on the distribution and biomass of benthic fauna.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Étiquettes directes de modèles (non validées)

Étiquettes de catégorie et de devis d'étude par modèle, issues des rondes d'étiquetage. C'est une sortie machine, non validée, et le désaccord entre modèles est livré comme donnée. Aucun devis ici n'est encore validé contre MEDLINE.

BrasCatégoriesDevis d'étudeConfiance
gemmaaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Jeu de données
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Sans objetlow
gptaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Jeu de données
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Sans objethigh
modèles en accordL'accord compare des ensembles de catégories et des devis identiques entre les bras.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,339
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,089
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Étiqueté directement par 2 modèles lisant le dossier complet.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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