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Enregistrement W3037430895 · doi:10.1016/j.prro.2020.05.013

Clinical Evaluation of Deep Learning and Atlas-Based Auto-Contouring of Bladder and Rectum for Prostate Radiation Therapy

2020· article· en· W3037430895 sur OpenAlexaff
W. Jeffrey Zabel, Jessica L. Conway, Adam Gladwish, Julia Skliarenko, Giulio DiDiodato, Leah Goorts-Matthews, Adam Michalak, Sarah Reistetter, Jenna King, Keith Nakonechny, Kyle Malkoske, Muoi N. Tran, Nevin McVicar

Notice bibliographique

RevuePractical Radiation Oncology · 2020
Typearticle
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueAdvanced Radiotherapy Techniques
Établissements canadiensUniversity of TorontoMcMaster UniversityRoyal Victoria Regional Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésContouringMedicineWorkflowAtlas (anatomy)Artificial intelligenceDeep learningProstate cancerWorkloadComputer scienceNuclear medicineMedical physicsComputer graphics (images)AnatomyCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Auto-contouring may reduce workload, interobserver variation, and time associated with manual contouring of organs at risk. Manual contouring remains the standard due in part to uncertainty around the time and workload savings after accounting for the review and editing of auto-contours. This preliminary study compares a standard manual contouring workflow with 2 auto-contouring workflows (atlas and deep learning) for contouring the bladder and rectum in patients with prostate cancer. METHODS AND MATERIALS: Three contouring workflows were defined based on the initial contour-generation method including manual (MAN), atlas-based auto-contour (ATLAS), and deep-learning auto-contour (DEEP). For each workflow, initial contour generation was retrospectively performed on 15 patients with prostate cancer. Then, radiation oncologists (ROs) edited each contour while blinded to the manner in which the initial contour was generated. Workflows were compared by time (both in initial contour generation and in RO editing), contour similarity, and dosimetric evaluation. RESULTS: Mean durations for initial contour generation were 10.9 min, 1.4 min, and 1.2 min for MAN, DEEP, and ATLAS, respectively. Initial DEEP contours were more geometrically similar to initial MAN contours. Mean durations of the RO editing steps for MAN, DEEP, and ATLAS contours were 4.1 min, 4.7 min, and 10.2 min, respectively. The geometric extent of RO edits was consistently larger for ATLAS contours compared with MAN and DEEP. No differences in clinically relevant dose-volume metrics were observed between workflows. CONCLUSION: Auto-contouring software affords time savings for initial contour generation; however, it is important to also quantify workload changes at the RO editing step. Using deep-learning auto-contouring for bladder and rectum contour generation reduced contouring time without negatively affecting RO editing times, contour geometry, or clinically relevant dose-volume metrics. This work contributes to growing evidence that deep-learning methods are a clinically viable solution for organ-at-risk contouring in radiation therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,444
Écart entre enseignants0,394 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations113
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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