Staphylococcus aureus bacteremia at a referral medical center in Kenya: A retrospective review of cases from 2010 to 2018
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Many studies have shown that Staphylococcus aureus is a leading cause of both community onset and hospital onset bloodstream infections. However, relatively little is known about the occurrence and outcome of S. aureus bacteremia in sub-Saharan Africa. A previous report indicated that S. aureus accounts for 16% of community onset and 6% of hospital onset bloodstream infections at Aga Khan University Hospital Nairobi (AKUHN). Data about the etiology of S. aureus bacteremia in sub-Saharan Africa will help optimize recognition and treatment. This study was performed in order to understand the etiologies and risk factors for S. aureus bacteremia in a sub-Saharan location. MATERIALS AND METHODS: A review of the electronic record of laboratory results from September 2010 through December 2018 identified 201 patients seen at AKUHN with S. aureus bacteremia. The source and/or focus of infection was identified and in-hospital mortality was determined. Cases with bacteremia after three days of hospitalization were considered hospital acquired. Community onset cases were divided into community acquired and health care associated. RESULTS: Most cases (71%; 143/201) were community onset, but only 41% (83/201) of these cases were community acquired. The most commonly identified foci of infection for community acquired bacteremia were musculoskeletal (25%; 21/83) and skin and soft tissue (24%; 20/83). The majority of health care associated (70%; 40/57) and hospital acquired cases (74%; 43/58) were associated with invasive vascular devices, with peripheral IVs being the most common for hospital acquired and dialysis catheters being the most common for health care associated infections. In-hospital mortality rates were 23% (19/83) for community acquired, 19% (11/57) for health care associated and 33% (19/58) for hospital acquired infections. CONCLUSION: Invasive vascular devices were associated with a substantial portion of cases of S. aureus bacteremia and provide an important target for infection control efforts.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».