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Enregistrement W3037599118 · doi:10.1136/jech-2020-214256

Does urbanicity modify the relationship between a polygenic risk score for depression and mental health symptoms? Cross-sectional evidence from the observational HUNT Study in Norway

2020· article· en· W3037599118 sur OpenAlexaff
Erik R. Sund, Frank J. van Lenthe, Mauricio Avendaño, Parminder Raina, Steinar Krokstad

Notice bibliographique

RevueJournal of Epidemiology & Community Health · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensMcMaster UniversityImpact
Organismes subventionnairesNorwegian Institute of Public HealthFaculty of Medicine and Health, University of SydneyEuropean CommissionNorges Teknisk-Naturvitenskapelige Universitet
Mots-clésAnxietyMedicineMental healthDepression (economics)Mental distressPsychiatryOdds ratioOddsObservational studyPatient Health QuestionnaireDemographyDistressClinical psychologyLogistic regressionInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Research suggests that genetic predisposition for common mental disorders may be moderated by the environment. This study examines whether a polygenic risk score (PRS) for depression is moderated by the level of residential area urbanicity using five symptoms of poor mental health as outcomes. METHODS: The study sample consisted of 41 198 participants from the 2006-2008 wave of the Norwegian HUNT study. We created a weighted PRS for depression based on 99 variants identified in a recent genome -wide association study. Participants were classified into urban or rural place of residence based on wards that correspond to neighbourhoods. Mixed effects logistic regression models with participants nested in 477 neighbourhoods were specified. RESULTS: A SD increase in PRS for depression was associated with a small but statistically significant increase in the odds of anxiety, comorbid anxiety and depression and mental distress. Associations for depression were weaker and not statistically significant. Compared with urban residents, rural resident had higher odds for reporting poor mental health. Genetic propensity for depression was higher for residents of urban than rural areas, suggesting gene-environment correlation. There was no sign of effect modification between genetic propensity and urbanicity for depression, anxiety, comorbid anxiety and depression, or mental distress. CONCLUSION: The PRS predicted small but significant odds of anxiety, comorbid anxiety and depression and mental distress, but we found no support for a differential effect of genetic propensity in urban and rural neighbourhoods for any of the outcomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,062
Score d'incertitude au seuil0,123

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,237
Tête enseignante GPT0,431
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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