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Enregistrement W3037867696 · doi:10.18433/jpps30602

A Simple Computational Tool for Accurate, Quantitative Prediction of One–Electron Reduction Potentials of Hypoxia–Activated Tirapazamine Analogues

2020· article· en· W3037867696 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
venuePublié dans une revue dont le pays d'attache est le Canada.

Notice bibliographique

RevueJournal of Pharmacy & Pharmaceutical Sciences · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueOrganic Chemistry Cycloaddition Reactions
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesAlberta Innovates
Mots-clésHOMO/LUMOChemistryDensity functional theoryComputational chemistryMoleculeOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The reduction potentials of bioreductively-activated drugs represent an important design parameter to be accommodated in the course of creating lead compounds and improving the efficacy of older generation drugs. Reduction potentials are traditionally reported as single-electron reduction potentials, E(1), measured against reference electrodes under strictly defined experimental conditions. More recently, computational chemists have described redox properties in terms of a molecule's highest occupied molecular orbital (HOMO) and lowest unoccupied molecular orbital (LUMO), in electron volts (eV). The relative accessibility of HOMO/LUMO data through calculation using today's computer infrastructure and simplified algorithms make the calculated value (LUMO) attractive in comparison to the accepted but rigorous experimental determination of E(1). This paper describes the correlations of eV (LUMO) to E(1) for three series of bioreductively-activated benzotriazine di-N-oxides (BTDOs), ring-substituted BTDOs, ring-added BTDOs and a selection of aromatic nitro compounds. The current computational approach is a closed-shell calculation with a single optimization. Gas phase geometry optimization was followed by a single-point DFT (Density Functional Theory) energy calculation in the gas phase or in the presence of polar solvent. The resulting DFT-derived LUMO energies (eV) calculated for BTDO analogues in gas phase and in presence of polar solvent (water) exhibited very strong linear correlations with high computational efficiency (r2 = 0.9925) and a very high predictive ability (MAD = 7 mV and RMSD = 9 mV) when compared to reported experimentally determined single-electron reduction potentials.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,113
Tête enseignante GPT0,394
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle