Association study of <i>DNAJC13, UCHL1, HTRA2, GIGYF2</i> and <i>EIF4G1</i> with Parkinson’s disease
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Rare mutations in genes originally discovered in multi-generational families have been associated with increased risk of Parkinson’s Disease (PD). The involvement of rare variants in DNAJC13, UCHL1, HTRA2, GIGYF2 and EIF4G1 loci have been poorly studied or produced conflicting results across cohorts. However, they are still being often referred to as “PD-genes” and used in different models. To further elucidate the role of these five genes in PD, we fully sequenced them using molecular inversion probes in 2,408 PD patients and 3,444 controls from 3 different cohorts. A total of 788 rare variants were identified across the five genes and three cohorts. Burden analyses and optimized sequence Kernel association tests revealed no significant association between any of the genes and PD after correction for multiple comparisons. Our results do not support an association of the five tested genes with PD. Combined with previous studies, it is unlikely that any of these genes plays an important role in PD. Their designation as “ PARK ” genes should be reconsidered.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».