Revisiting Ceriantharian (Anthozoa) Mitochondrial Genomes: Casting Doubts about Their Structure and Size
Notice bibliographique
Résumé
Recently, Stampar et al. (2019. Linear mitochondrial genome in Anthozoa (Cnidaria): a case study in. Sci Rep. 9(1):6094.) uncovered highly atypical mitochondrial genome structures in the cnidarian species Pachycerianthus magnus and Isarachnanthus nocturnus (Anthozoa, Ceriantharia). These two mitochondrial DNAs assembled as linear fragmented genomes, comprising eight and five chromosomes, respectively-architectures unlike any other anthozoan mitogenome described to date. What's more, they have cumulative lengths of 77.8 (P. magnus) and 80.9 kb (I. nocturnus), making them the largest animal mitochondrial DNAs on record, a finding which garnered significant attention by various news media. Here, I take a closer look at the work of Stampar et al. and question their key results. I provide evidence that the currently available mitogenome sequences for I. nocturnus and P. magnus, including their structures, sizes, and chromosome numbers, should be treated with caution. More work must be done on these genomes before one can say with any certainty that they are linear, fragmented, or the largest animal mitogenomes observed to date.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,020 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,003 |
| Communication savante | 0,002 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,023 | 0,024 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».