MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3038121484 · doi:10.1101/2020.06.29.176990

A single nucleotide change underlies the genetic assimilation of a plastic trait

2020· preprint· en· W3038121484 sur OpenAlexaff
Paul Vigne, Clotilde Gimond, Céline Ferrari, Anne Vielle, Johan Hallin, Ania Pino-Querido, Sonia El Mouridi, Christian Frøkjær‐Jensen, Thomas Boulin, Henrique Teotónio, Christian Braendle

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesCentre National de la Recherche ScientifiqueKing Abdullah University of Science and TechnologyInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleNational Institutes of HealthAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésBiologyGeneticsTraitGenetic FitnessAlleleNatural selectionMutantPhenotypeCaenorhabditis elegansHatchingEvolutionary biologyGeneSelection (genetic algorithm)Ecology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genetic assimilation – the evolutionary process by which an ancestral environmentally sensitive phenotype is made constitutive – is a fundamental concept in biology. Its evolutionary relevance is debated, and our understanding of its prevalence, and underlying genetics and molecular mechanisms, is poor. Matricidal hatching is an extreme form of maternal provisioning induced by adverse conditions, which varies among Caenorhabditis elegans populations. We identified wild isolates, sampled from natural populations across multiple years and locations, that express a derived state of near-constitutive matricidal hatching. A single amino acid change in kcnl-1 , encoding a small-conductance calcium-activated potassium channel subunit, explains most of this variation. A gain-of-function mutation altering the S6 transmembrane domain causes inappropriate activation of the K + channel, leading to reduced vulval muscle excitability, and thus reduced expulsion of embryos, irrespective of environment. Using reciprocal allelic replacements, we show that this amino acid change is sufficient to induce constitutive matricidal hatching whilst re-establishing the ancestral protein abolishes matricidal hatching and restores egg-laying, thereby doubling lifetime reproductive fitness under benign conditions. While highly deleterious in the laboratory, experimental evolution showed that KNCL-1(V530L) is maintained under fluctuating resource availability. Selection on a single point mutation can therefore underlie the genetic assimilation of an ancestrally plastic trait with drastic life-history consequences.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,188 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms→Travaux en français237 207→