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Enregistrement W3038281272 · doi:10.1017/s1431927600033870

3D Reconstruction from STEM Images of Xanthine Dehydrogenase and Insulin Receptor: Refinements and Molecular Modelling.

2000· article· en· W3038281272 sur OpenAlexaff
DR Beniac, RZ-T Luo, AB Fernandes, Tomio Iwasaki, CC Yip, F.P. Ottensmeyer

Notice bibliographique

RevueMicroscopy and Microanalysis · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésXanthineInsulin receptorComputational biologyChemistryComputer scienceInsulinBiochemistryBiologyMedicineInternal medicineEnzymeInsulin resistance

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract We have reconstructed the three-dimensional quaternary structure of the complete 480 kDa insulin receptor (IR), complexed with Nanogold - labeled insulin, and the 290 kDa Xanthine Dehydrogenase (XDH). Both molecules were imaged by low-dose, low-temperature dark field scanning transmission electron microscopy (STEM). XDH and IR were both freeze-plunged in liquid ethane, and transferred to the STEM (VG HB 601) where they were freeze dried at -130°C. Reconstruction was carried out using the method of quaternion-assisted angular reconstruction (IQAD) as described previously. XDH was further refined by an iterative process in which the IQAD produced volume was used as a reference for further refinements. Separate reconstructions of two sets of half the images indicated an inter-reconstruction resolution of 20 Å and 9 Å by phase residual criteria for the IR and XDH reconstructions, respectively.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,027
Score d'incertitude au seuil0,686

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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