Polymorphism of the <i>PLIN1</i> gene and its association with body measures and ultrasound carcass traits in Qinchuan beef cattle
Notice bibliographique
Résumé
The PLIN1 gene produces a phosphorylated protein wrapped in lipid droplets in adipocytes. This phosphorylation assists the mobilization of fat into adipose tissue. The purpose of the experiment was to study the polymorphism of the PLIN1 gene and its relationship with the body and carcass characteristics of Qinchuan cattle to find molecular genetic markers that can be used for breeding. The expression level of the PLIN1 gene was determined in various tissues by qRT-PCR. The results showed that the highest level of PLN1 expression was found in subcutaneous fat, followed by the heart and longissimus muscle, and the lowest level was found in the kidney. Five SNP loci of the PLIN1 gene were identified in 510 Qinchuan cattle, including g.3580T>C (SNP1), g.3898G>A (SNP2), g.8333G>A (SNP3), g.10517T>C (SNP4), and g.10538G>T (SNP5). The results show that SNP1, SNP2, SNP3, and SNP4 were moderately polymorphic (0.25 < PIC < 0.5), while SNP5 was minimally polymorphic (PIC < 0.25). SNP2, SNP3, and SNP5 were within Hardy–Weinberg equilibrium (P > 0.05), but SNP1 and SNP4 were not (P < 0.05). Correlation analysis showed that the five SNPs of the PLIN1 gene were correlated with back-fat depth, intramuscular fat, and chest depth of Qinchuan cattle. The double haplotype H2H4 in Qinchuan beef was associated with body and carcass traits. We conclude that variants mapped within PLIN1 can be used in marker-assisted selection for carcass quality and body traits in breed improvement programs for Qinchuan cattle.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».