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Enregistrement W3038495334 · doi:10.3389/fpls.2020.00916

A PGPR-Produced Bacteriocin for Sustainable Agriculture: A Review of Thuricin 17 Characteristics and Applications

2020· review· en· W3038495334 sur OpenAlexafffund
Mahtab Nazari, Donald L. Smith

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Plant Science · 2020
Typereview
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueProbiotics and Fermented Foods
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food Canada
Mots-clésBacteriocinRhizobacteriaBiologyAbiotic stressCompetition (biology)Bacillus thuringiensisNicheBacteriaBotanyBiotechnologyMicrobiologyRhizosphereAntimicrobialEcologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Many prokaryotes produce and excrete bacteriocins (proteins with antimicrobial activity) to reduce competition from related strains. Bacteriocins are import in food industries, while little research has been focused on the agricultural potential of bacteriocins. Some bacteriocin producing bacteria are members of the phytomicrobiome; some strains are plant growth promoting rhizobacteria (PGPR). Thuricin 17 is a small peptide (3.162 kDa), a subclass IId bacteriocin produced by Bacillus thuringiensis NEB17, isolated from soybean nodules and thus a member of the phytomicrobiome. It is either cidal or static to a wide range of prokaryotes. In this way, it removes key competition from the niche space of the producer organism. Interestingly, thuricin 17 is not active against a wide range of rhizobial strains involved in symbiotic nitrogen fixation with legumes or against other PGPRs. In addition, it stimulates plant growth, particularly in the presence of abiotic stresses. The stresses it assists with include key ones associated with climate change (drought, high temperature, soil salinity). Hence, in the presence of stress it increases the size of the overall niche space, within plant roots, for B. thuringiensis NEB17. Through its anti-microbial activity, it could also enhance plant growth via control of specific plant pathogens. None of the isolated bacteriocins have been examined as broadly as thuricin 17 on plant growth promotion. Thus, this review focuses on the effect of thuricin 17 as a microbe to plant signal that assists crop plants in managing stress and making agricultural systems more climate change resilient.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations121
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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