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Enregistrement W3038783874 · doi:10.1038/s41598-020-67871-0

Chloroplast DNA analysis of the invasive weed, Himalayan balsam (Impatiens glandulifera), in the British Isles

2020· article· en· W3038783874 sur OpenAlexfundno aff
Daisuke Kurose, Kathryn M. Pollard, C. A. Ellison

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBiological Control of Invasive Species
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAustralian Centre for International Agricultural ResearchAgriculture and Agri-Food CanadaDepartment for Environment, Food and Rural Affairs, UK GovernmentMinistry of Agriculture of the People's Republic of ChinaDepartment for International DevelopmentNatural England
Mots-clésBalsamImpatiensWeedChloroplast DNABalsaminaceaeBotanyBiologyChloroplastGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Impatiens glandulifera or Himalayan balsam (HB), is an invasive alien weed throughout the British Isles (BI). Classical biological control of HB in the BI using a rust fungus from the Himalayan native range was implemented in 2014. However, not all HB populations are susceptible to the two rust strains currently released. Additional strains are needed that infect resistant populations in order to achieve successful control. These are best sourced from the historical collecting sites. A molecular analysis was conducted using six chloroplast DNA sequences from leaf material from across the BI and the native range. Herbarium samples collected in the Himalayas between 1881 and 1956 were also included. Phylogenetic analyses resulted in the separation of two distinct groups, one containing samples from the BI and the native range, and the other from the BI only; suggesting that HB was introduced into the BI on at least two occasions. The former group is composed of two subgroups, indicating a third introduction. Ten and 15 haplotypes were found in the introduced and native range respectively, and with two of these found in both regions. Results show where to focus future surveys in the native range to find more compatible rust strains.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,524
Score d'incertitude au seuil0,987

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,003
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,197
Écart entre enseignants0,174 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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