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Enregistrement W3038926436 · doi:10.1001/jamaoncol.2020.2134

Characterization of the Cancer Spectrum in Men With Germline<i>BRCA1</i>and<i>BRCA2</i>Pathogenic Variants

2020· article· en· W3038926436 sur OpenAlexafffund
Valentina Silvestri, Goska Leslie, Daniel R. Barnes, Bjarni A. Agnarsson, Kristiina Aittomäki, Elisa Alducci, Irene L. Andrulis, Rósa B. Barkardóttir, Alicia Barroso, Daniel Barrowdale, Javier Benı́tez, Bernardo Bonanni, Åke Borg, Saundra S. Buys, Trinidad Caldés, Maria A. Caligo, Carlo Capalbo, Ian Campbell, Wendy K. Chung, Kathleen Claes, Sarah V. Colonna, Laura Cortesi, Fergus J. Couch, Miguel de la Hoya, Orland Dı́ez, Yuan Chun Ding, Susan M. Domchek, Douglas F. Easton, Bent Ejlertsen, Christoph Engel, D. Gareth Evans, Lídia Feliubadaló, Lenka Foretová, Florentia Fostira, Lajos Géczi, Anne‐Marie Gerdes, Gord Glendon, Andrew K. Godwin, David E. Goldgar, Eric Hahnen, Frans B.L. Hogervorst, John L. Hopper, Peter J. Hulick, Claudine Isaacs, Á. Izquierdo, Paul A. James, Ramūnas Janavičius, Uffe Birk Jensen, Esther M. John, Joseph Vijai, Irene Konstantopoulou, Allison W. Kurian, Ava Kwong, Elisabetta Landucci, Fabienne Lesueur, Jennifer T. Loud, Eva Macháčková, Keivan Majidzadeh‐A, Siranoush Manoukian, Marco Montagna, Lidia Moserle, Anna Marie Mulligan, Katherine L. Nathanson, Heli Nevanlinna, Joanne Ngeow, Liene Ņikitina-Zaķe, Kenneth Offit, Edith Olah, Olufunmilayo I. Olopade, Ana Osório, Laura Papi, Sue K. Park, Inge Søkilde Pedersen, Pedro Pérez‐Segura, Annabeth Høgh Petersen, Pedro Pinto, Berardino Porfirio, Miquel Angel Pujana, Paolo Radice, Johanna Rantala, Muhammad Usman Rashid, Barak Rosenzweig, Maria Rossing, Marta Santamariña, Rita K. Schmutzler, Leigha Senter, Jacques Simard, Christian F. Singer, Ángela R. Solano, Melissa C. Southey, Linda Steele, Zoe Steinsnyder, Dominique Stoppa‐Lyonnet, Yen Y. Tan, Manuel R. Teixeira, Soo‐Hwang Teo, Mary Beth Terry, Mads Thomassen, Amanda E. Toland, Sara Torres‐Esquius, Nadine Tung, Christi J. van Asperen, Ana Vega, Alessandra Viel, Jeroen Vierstraete, Barbara Wappenschmidt, Jeffrey N. Weitzel, Greet Wieme, Sook‐Yee Yoon, Kristin K. Zorn, Lesley McGuffog, Michael T. Parsons, Ute Hamann, Mark H. Greene, Judy A. Kirk, Susan L. Neuhausen, Timothy R. Rebbeck, Marc Tischkowitz, Georgia Chenevix‐Trench, Antonis C. Antoniou, Eitan Friedman, Laura Ottini

Notice bibliographique

RevueJAMA Oncology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensUniversité LavalUniversity of TorontoUniversity Health NetworkCentre hospitalier universitaire de QuébecLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesKlinisk Institut, Aalborg UniversitetServicio Gallego de SaludLee Kong Chian School of Medicine, Nanyang Technological UniversityEuropean Regional Development FundMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchManchester Biomedical Research CentreFox Chase Cancer CenterNational Institutes of HealthCentro de Investigación Biomédica en Red de CáncerNational Cancer InstituteLiga Portuguesa Contra o CancroNational Institute of General Medical SciencesInstitut National Du CancerTel Aviv UniversityMinisterio de Economía y CompetitividadLandspítali HáskólasjúkrahúsAalborg UniversitetshospitalFondation ARC pour la Recherche sur le CancerMedizinische Universität WienKarolinska InstitutetHungarian Scientific Research FundGentofte HospitalNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekMinistero della SaluteGeneralitat de CatalunyaAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroAalborg UniversitetDeutsche KrebshilfeNational Breast Cancer FoundationSeoul National UniversityUniversität WienCancer AustraliaNational Institute for Health and Care ResearchGeorgetown UniversityNanyang Technological UniversityCentre Hospitalier Universitaire de QuébecIstituto Oncologico VenetoHelsingin YliopistoUniversité LavalCentres de Recerca de CatalunyaKWF KankerbestrijdingCancer Research UKMemorial Sloan-Kettering Cancer CenterWellcome TrustCollege of Medicine, Seoul National UniversitySusan G. Komen for the CureNational Cancer Centre of SingaporeDeutsches KrebsforschungszentrumUniversità degli Studi di FirenzeInstituto de Investigación Sanitaria de Santiago de CompostelaMinistério da Ciência, Tecnologia e InovaçãoKansas Bioscience AuthorityUniversity of ChicagoCancer Research InstituteDr. Ralph and Marian Falk Medical Research TrustCancer Center, University of KansasCancerfondenFundación Mutua MadrileñaRigshospitaletNational Health and Medical Research CouncilFisher Center for Alzheimer's Research FoundationInstituto de Salud Carlos IIIOhio State UniversityInstitut Català de la SalutUniversity of PennsylvaniaEuropean CommissionBreast Cancer Research Foundation
Mots-clésMedicineGermlineCancerBRCA2 ProteinGermline mutationOncologyGeneticsMutationInternal medicineGeneBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Importance: The limited data on cancer phenotypes in men with germline BRCA1 and BRCA2 pathogenic variants (PVs) have hampered the development of evidence-based recommendations for early cancer detection and risk reduction in this population. Objective: To compare the cancer spectrum and frequencies between male BRCA1 and BRCA2 PV carriers. Design, Setting, and Participants: Retrospective cohort study of 6902 men, including 3651 BRCA1 and 3251 BRCA2 PV carriers, older than 18 years recruited from cancer genetics clinics from 1966 to 2017 by 53 study groups in 33 countries worldwide collaborating through the Consortium of Investigators of Modifiers of BRCA1/2 (CIMBA). Clinical data and pathologic characteristics were collected. Main Outcomes and Measures: BRCA1/2 status was the outcome in a logistic regression, and cancer diagnoses were the independent predictors. All odds ratios (ORs) were adjusted for age, country of origin, and calendar year of the first interview. Results: Among the 6902 men in the study (median [range] age, 51.6 [18-100] years), 1634 cancers were diagnosed in 1376 men (19.9%), the majority (922 of 1,376 [67%]) being BRCA2 PV carriers. Being affected by any cancer was associated with a higher probability of being a BRCA2, rather than a BRCA1, PV carrier (OR, 3.23; 95% CI, 2.81-3.70; P < .001), as well as developing 2 (OR, 7.97; 95% CI, 5.47-11.60; P < .001) and 3 (OR, 19.60; 95% CI, 4.64-82.89; P < .001) primary tumors. A higher frequency of breast (OR, 5.47; 95% CI, 4.06-7.37; P < .001) and prostate (OR, 1.39; 95% CI, 1.09-1.78; P = .008) cancers was associated with a higher probability of being a BRCA2 PV carrier. Among cancers other than breast and prostate, pancreatic cancer was associated with a higher probability (OR, 3.00; 95% CI, 1.55-5.81; P = .001) and colorectal cancer with a lower probability (OR, 0.47; 95% CI, 0.29-0.78; P = .003) of being a BRCA2 PV carrier. Conclusions and Relevance: Significant differences in the cancer spectrum were observed in male BRCA2, compared with BRCA1, PV carriers. These data may inform future recommendations for surveillance of BRCA1/2-associated cancers and guide future prospective studies for estimating cancer risks in men with BRCA1/2 PVs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations67
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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