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Enregistrement W3038928900 · doi:10.1136/bmjopen-2019-035538

International prospective observational study investigating the disease course and heterogeneity of paediatric-onset inflammatory bowel disease: the protocol of the PIBD-SETQuality inception cohort study

2020· article· en· W3038928900 sur OpenAlexaff
M Aardoom, Polychronis Kemos, Irma Tindemans, Marina Aloi, Sibylle Koletzko, Arie Levine, Dan Turner, Gigi Veereman, Mattias Neyt, Richard K. Russell, Thomas D. Walters, Frank M. Ruemmele, Janneke N. Samsom, Nicholas M. Croft, Lissy de Ridder

Notice bibliographique

RevueBMJ Open · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesHorizon 2020 Framework Programme
Mots-clésMedicineInflammatory bowel diseaseObservational studyDiseaseProspective cohort studyCohort studyCohortIntensive care medicineAdverse effectQuality of life (healthcare)PediatricsInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Patients with paediatric-onset inflammatory bowel disease (PIBD) may develop a complicated disease course, including growth failure, bowel resection at young age and treatment-related adverse events, all of which can have significant and lasting effects on the patient's development and quality of life. Unfortunately, we are still not able to fully explain the heterogeneity between patients and their disease course and predict which patients will respond to certain therapies or are most at risk of developing a more complicated disease course. To investigate this, large prospective studies with long-term follow-up are needed. Currently, no such European or Asian international cohorts exist. In this international cohort, we aim to evaluate disease course and which patients are most at risk of therapy non-response or development of complicated disease based on patient and disease characteristics, immune pathology and environmental and socioeconomic factors. METHODS AND ANALYSIS: In this international prospective observational study, which is part of the PIBD Network for Safety, Efficacy, Treatment and Quality improvement of care (PIBD-SETQuality), children diagnosed with inflammatory bowel disease <18 years are included at diagnosis. The follow-up schedule is in line with standard PIBD care and is intended to continue up to 20 years. Patient and disease characteristics, as well as results of investigations, are collected at baseline and during follow-up. In addition, environmental factors are being assessed (eg, parent's smoking behaviour, dietary factors and antibiotic use). In specific centres with the ability to perform extensive immunological analyses, blood samples and intestinal biopsies are being collected and analysed (flow cytometry, plasma proteomics, mRNA expression and immunohistochemistry) in therapy-naïve patients and during follow-up. ETHICS AND DISSEMINATION: Medical ethical approval has been obtained prior to patient recruitment for all sites. The results will be disseminated through peer-reviewed scientific publications. TRIAL REGISTRATION NUMBER: NCT03571373.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,019
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,019
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,101

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0190,019
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0010,004
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0030,003
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,068
Tête enseignante GPT0,387
Écart entre enseignants0,319 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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