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Enregistrement W3039098600 · doi:10.1101/2020.07.05.188334

Copper nanoparticles prompt the activity of estuarine denitrifying bacterial communities at relevant environmental concentrations

2020· preprint· en· W3039098600 sur OpenAlexaff
Joana Costa, António G. G. Sousa, Ana Carolina Carneiro, Ana P. Mucha, C. Marisa R. Almeida, Catarina Magalhães, Mafalda S. Baptista

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesEuropean Regional Development FundFundação para a Ciência e a Tecnologia
Mots-clésDenitrifying bacteriaDenitrificationNitrite reductaseEnvironmental chemistryNitrous-oxide reductaseBiotaMicrocosmChemistryEstuaryNitrous oxideGene expressionNitriteGeneNitrateBiologyEcologyBiochemistryNitrogen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Effects of metallic nanoparticles (NPs) to the estuarine biota have mostly been shown for concentrations higher than those actually measured or predicted in these environments. To address this gap, a range of concentrations expected to occur in estuarine environments (from 0.01 to 1 μg g-1) was employed in microcosms studies to assess the impact of Cu NPs in the denitrification pathway. That was achieved by quantifying gene expression and the potential denitrification rate in estuarine sediments exposed to Cu NPs for up to six days. Expression of nitrite ( nirS ) and nitrous oxide ( nosZ ) reductase genes was enhanced in a timewise manner. For the highest Cu NPs (1 μg g -1 ) an increase in gene expression could be seen immediately after 1 h of exposure, and continuing to be enhanced up until 7 h of exposure. For the lowest Cu NPs (0.01 μg g -1 ) an increase in gene expression could only be seen after 4 h or 7 h of exposure; however it continued to rise up until 24 h of exposure. In any case, after 48 h the expression levels were no longer different from the non-exposed control. Concomitantly to increased gene expression the potential denitrification rate was increased by 30 %. Our results suggest that deposition and adsorption of Cu NPs to estuarine sediments promotes the immediate and transient expression of key genes of the denitrification pathway. The long term impact of continuous inputs of Cu NPs into estuaries deserves renewed analysis to account for their effects, not just on the biota, but especially on ecosystems services. Environmental significance Interactions of metallic nanoparticles with microbial communities of estuarine sediments are poorly characterized and its impact towards ecosystem services even less. By assessing the effect of copper nanoparticles on the expression of key genes of the denitrification pathway, an essential step for nitrogen (N) removal, we were able to show that denitrifying communities are immediately activated after exposure, increasing the denitrification rates in estuaries. The importance of denitrification lies in its release of dinitrogen (N 2 ) to the atmosphere but also in the emissions of N 2 O (a potent greenhouse gas). The results obtained in this study gather data that contribute information on the denitrification dynamics in estuaries, invaluable for a timely response to the expected upcoming changes in coastal areas. Table of contents In estuaries the deposition upon the sediments of copper nanoparticles can contribute to change metal availability and promote the activity of denitrifying bacteria

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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