Docosahexaenoic acid alters cell death, cancer and cell‐cycle signaling networks in breast cancer cell lines
Notice bibliographique
Résumé
Long‐chain n‐3 polyunsaturated fatty acids reduce viability of breast cancer cells. While the products of several genes are altered, the changes in gene expression responsible for these antitumor effects have not been clearly established. The objective of this study was to measure alterations in gene expression in breast cancer cells treated with docosahexaenoic (DHA) and eicosapentaneoic (EPA) acid. MDA‐MB‐231 (estrogen receptor, ER‐) and MCF‐7 (ER+) human breast cancer cells were treated with control media, 100 μM linoleic acid, DHA or EPA for 48 h. Gene expression was analyzed using Affymetrix GeneChip Human Gene ST 1.0 microarray chips and data analyzed using Partek Genomics Suite and Ingenuity Pathway Analysis. Principal Component Analysis revealed that treatment accounted for 40% of the alteration in gene expression in both cell lines. Compared to control, fatty acids changed networks of lipid metabolism and small molecule biochemistry (P<0.05). DHA altered cancer, cell death and tumor morphology cellular signaling networks, compared with other conditions, while EPA impacted an array of non‐cancer related networks (P<0.05). A number of previously unidentified genes were differentially expressed in response to DHA treatment. This study provides an understanding of the genomic changes induced by n‐3 PUFA in breast cancer cells. Funding from CIHR and JBE received a CIHR postdoctoral fellowship.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».