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Enregistrement W3039642489 · doi:10.1002/cti2.1149

Mass cytometry reveals immune signatures associated with cytomegalovirus (CMV) control in recipients of allogeneic haemopoietic stem cell transplant and CMV‐specific T cells

2020· article· en· W3039642489 sur OpenAlexaff
Helen M. McGuire, Simone Rizzetto, Barbara Withers, Leighton Clancy, Selmir Avdic, Lauren Stern, Ellis Patrick, Barbara Fazekas de St Groth, Barry Slobedman, David Gottlieb, Fabio Luciani, Emily Blyth

Notice bibliographique

RevueClinical & Translational Immunology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytomegalovirus and herpesvirus research
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesSydney Medical SchoolMedical Research CouncilLeukaemia FoundationCancer Council NSWNational Health and Medical Research CouncilRoyal College of Pathologists of Australasia
Mots-clésCytomegalovirusStem cellMass cytometryImmune systemBiologyVirologyImmunologyFlow cytometryHerpesviridaeHuman immunodeficiency virus (HIV)Viral diseaseCell biologyGeneticsPhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Objectives Cytomegalovirus (CMV) is known to have a significant impact on immune recovery post‐allogeneic haemopoietic stem cell transplant (HSCT). Adoptive therapy with donor‐derived or third‐party virus‐specific T cells (VST) can restore CMV immunity leading to clinical benefit in prevention and treatment of post‐HSCT infection. We developed a mass cytometry approach to study natural immune recovery post‐HSCT and assess the mechanisms underlying the clinical benefits observed in recipients of VST. Methods A mass cytometry panel of 38 antibodies was utilised for global immune assessment (72 canonical innate and adaptive immune subsets) in HSCT recipients undergoing natural post‐HSCT recovery ( n = 13) and HSCT recipients who received third‐party donor‐derived CMV‐VST as salvage for unresponsive CMV reactivation ( n = 8). Results Mass cytometry identified distinct immune signatures associated with CMV characterised by a predominance of innate cells (monocytes and NK) seen early and an adaptive signature with activated CD8 + T cells seen later. All CMV‐VST recipients had failed standard antiviral pharmacotherapy as a criterion for trial involvement; 5/8 had failed to develop the adaptive immune signature by study enrolment despite significant CMV antigen exposure. Of these, VST administration resulted in development of the adaptive signature in association with CMV control in three patients. Failure to respond to CMV‐VST in one patient was associated with persistent absence of the adaptive immune signature. Conclusion The clinical benefit of CMV‐VST may be mediated by the recovery of an adaptive immune signature characterised by activated CD8 + T cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,741
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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