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Enregistrement W3040179002 · doi:10.1111/1758-2229.12867

Novel insights into the taxonomic diversity and molecular mechanisms of bacterial Mn( <scp>III</scp> ) reduction

2020· article· en· W3040179002 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Microbiology Reports · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Fuel Cells and Bioremediation
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNASA Astrobiology InstituteCenter for Dark Energy Biosphere InvestigationsNational Aeronautics and Space Administration
Mots-clésBetaproteobacteriaGammaproteobacteriaBiologyMetagenomicsEcologyBacteriaActinobacteria16S ribosomal RNABiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Soluble ligand-bound Mn(III) can support anaerobic microbial respiration in diverse aquatic environments. Thus far, Mn(III) reduction has only been associated with certain Gammaproteobacteria. Here, we characterized microbial communities enriched from Mn-replete sediments of Lake Matano, Indonesia. Our results provide the first evidence for the biological reduction of soluble Mn(III) outside the Gammaproteobacteria. Metagenome assembly and binning revealed a novel betaproteobacterium, which we designate 'Candidatus Dechloromonas occultata.' This organism dominated the enrichment and expressed a porin-cytochrome c complex typically associated with iron-oxidizing Betaproteobacteria and a novel cytochrome c-rich protein cluster (Occ), including an undecaheme putatively involved in extracellular electron transfer. This occ gene cluster was also detected in diverse aquatic bacteria, including uncultivated Betaproteobacteria from the deep subsurface. These observations provide new insight into the taxonomic and functional diversity of microbially driven Mn(III) reduction in natural environments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,531

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,154
Écart entre enseignants0,148 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle