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Enregistrement W3040445094 · doi:10.3389/fneur.2020.00548

Longitudinal Monitoring of Parkinson's Disease in Different Ethnic Cohorts: The DodoNA and LONG-PD Study

2020· article· en· W3040445094 sur OpenAlexaboutno aff
Katerina Markopoulou, Jan Aasly, Sun Ju Chung, Efthimios Dardiotis, Karin Wirdefeldt, Ashvini P. Premkumar, Bernadette Schoneburg, Ninith Kartha, Gary Wilk, Jun Wei, Kelly Claire Simon, Samuel Tideman, Alexander Epshteyn, Bryce Hadsell, L. Sergio Garduño, Anna Pham, Roberta Frigerio, Demetrius M. Maraganore

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Neurology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParkinson's Disease Mechanisms and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAgency for Healthcare Research and Quality
Mots-clésCohortMontreal Cognitive AssessmentMedicinePhysical therapyDementiaCohort studyFamily historyClinical Dementia RatingDiseasePsychologyGerontologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Different factors influence severity, progression and outcomes in Parkinson’s disease (PD). Lack of standardized clinical assessment limits comparison of outcomes and availability of well-characterized cohorts for collaborative studies. Methods: We developed structured clinical documentation support (SCDS) and launched the DNA Predictions to Improve Neurological Health (DodoNA) project eight years ago to standardize clinical assessment and identify molecular predictors of disease progression. The Longitudinal Clinical and Genetic Study of Parkinson’s Disease (LONG-PD) cohort was launched five years ago using a Research Electronic Data Capture (REDCap) format mirroring the DodoNA SCDS within the Genetic Epidemiology of Parkinson’s disease (GEoPD) consortium. Four sites in different countries participated in the LONG-PD study. Demographics, education, exposures, age at onset (AAO), Unified Parkinson’s Disease Rating Scale (UPDRS) parts I-VI or Movement Disorders Society (MDS)-UPDRS, Montreal Cognitive Assessment (MOCA)/Short Test of Mental Status (STMS)/ Mini Mental State Examination (MMSE), Geriatric Depression Scale (GDS), Epworth Sleepiness Scale (ESS), dopaminergic therapy, family history, nursing home placement, death and blood samples were collected. 658 participants from the DodoNA cohort with six years of follow-up and 496 participants from the LONG-PD cohort with up to three years of follow-up were included. Group-based trajectory modeling (GBTM) analysis focused on: AAO, education, family history, MMSE/MoCA/STMS., UPDRS II-II, UPDRS-III tremor and bradykinesia sub-scores, H&Y stage, disease subtype and dopaminergic therapy. The DodoNA cohort served as the training and the LONG-PD cohort as the test set. Results: Both cohorts show separation of patients in a slowly progressing and a rapidly progressing course. AAO, MMSE score, H &Y stage, UPDRS-III tremor and bradykinesia sub-scores classified patients in either group. Late AAO and male sex, assigned patients to the rapidly progressing group, whereas tremor to the slower progressing group. Patient classification occurs relatively early in the disease course. Conclusions: Standardized clinical assessment provides accurate characterization of the clinical phenotype in pragmatic clinical settings. Trajectory analysis demonstrated two different trajectories of disease progression, identified determinants of classification and demonstrated SCDS’s utility in developing well characterized cohorts which in conjunction with genomic analysis can elucidate disease etiology, leading to targeted therapies that can improve disease outcomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,043
Score d'incertitude au seuil0,085

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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