Methylation-sensitive amplification polymorphism analysis reveals the DNA methylation dynamics during capitulum development in <i>Chrysanthemum lavandulifolium</i>
Notice bibliographique
Résumé
Chrysanthemum lavandulifolium (Fischer ex Trautv.) Makino is a diploid plant belonging to the Asteraceae family, with typical capitula composed of female ray florets and bisexual disc florets. The differentiation and development of these two types of florets have long been important research focuses; however, the potential epigenetic mechanisms governing these processes have not been elucidated. In the present study, methylation-sensitive amplification polymorphism method was used to trace the dynamic changes of DNA methylation during capitulum development in C. lavandulifolium. DNA methylation patterns and levels were detected in the whole capitula during seven developmental stages, and the obtained results revealed that DNA demethylation was dominant during this process. In addition, DNA methylation patterns and levels showed significant differences between ray and disc florets. Moreover, the expression patterns of candidate genes potentially involved in the development processes of two types of florets were analyzed by real-time quantitative reverse transcription polymerase chain reaction, and correlation analysis indicated that the expression levels of ClPI, ClAG2, ClSEP1, ClCYC2c, ClCYC2d, and ClCYC2e were highly correlated with DNA methylation levels. These results indicate that DNA methylation may be involved in the differentiation and development of ray and disc florets. This study provides epigenetic insights into the capitulum development in C. lavandulifolium.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».