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Enregistrement W3040650012 · doi:10.1038/s41571-020-0392-0

ctDNA applications and integration in colorectal cancer: an NCI Colon and Rectal–Anal Task Forces whitepaper

2020· review· en· W3040650012 sur OpenAlexaff
Arvind Dasari, Van K. Morris, Carmen J. Allegra, Chloé E. Atreya, Al B. Benson, Patrick M. Boland, Ki Yong Chung, Mehmet Sitki Copur, Ryan B. Corcoran, Dustin A. Deming, Andrea Dwyer, Maximilian Diehn, Cathy Eng, Thomas J. George, Marc J. Gollub, Rachel Goodwin, Stanley R. Hamilton, Jaclyn F. Hechtman, Howard S. Höchster, Theodore S. Hong, Federico Innocenti, Atif Iqbal, Samuel A. Jacobs, Hagen F. Kennecke, James J. Lee, Christopher H. Lieu, Heinz‐Josef Lenz, O. Wolf Lindwasser, Clara Montagut, Bruno C. Odisio, Fang‐Shu Ou, Laura Porter, Kanwal Raghav, Deborah Schrag, Aaron J. Scott, Qian Shi, John H. Strickler, Alan P. Venook, Rona Yaeger, Greg Yothers, Y. Nancy You, Jason A. Zell, Scott Kopetz

Notice bibliographique

RevueNature Reviews Clinical Oncology · 2020
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensOttawa Hospital
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Cancer Institute
Mots-clésMedicineColorectal cancerMultidisciplinary approachTask forceOncologyInternal medicineMinimal residual diseaseDiseaseMEDLINECancerIntensive care medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An increasing number of studies are describing potential uses of circulating tumour DNA (ctDNA) in the care of patients with colorectal cancer. Owing to this rapidly developing area of research, the Colon and Rectal-Anal Task Forces of the United States National Cancer Institute convened a panel of multidisciplinary experts to summarize current data on the utility of ctDNA in the management of colorectal cancer and to provide guidance in promoting the efficient development and integration of this technology into clinical care. The panel focused on four key areas in which ctDNA has the potential to change clinical practice, including the detection of minimal residual disease, the management of patients with rectal cancer, monitoring responses to therapy, and tracking clonal dynamics in response to targeted therapies and other systemic treatments. The panel also provides general guidelines with relevance for ctDNA-related research efforts, irrespective of indication.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,449
Écart entre enseignants0,400 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations365
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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