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Enregistrement W3040915137 · doi:10.1002/humu.24075

The expanding clinical phenotype of germline <i>ABL1</i> ‐associated congenital heart defects and skeletal malformations syndrome

2020· article· en· W3040915137 sur OpenAlexaff
Chun‐An Chen, Emeline Crutcher, Harinder Gill, Tanya N. Nelson, Laurie Robak, Marjolijn C.J. Jongmans, Rolph Pfundt, Chitra Prasad, Roberta Berard, Madeleine Fannemel, Eirik Frengen, Doriana Misceo, Keri Ramsey, Yaping Yang, Christian P. Schaaf, Xia Wang

Notice bibliographique

RevueHuman Mutation · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRenal and related cancers
Établissements canadiensChildren’s Health Research InstituteWestern UniversityChildren's Hospital of Western OntarioBC Children's HospitalB.C. Women's Hospital & Health CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGermlineMissense mutationFailure to thrivePhenotypeHypoplasiaGermline mutationGeneticsInternal medicineMutationMedicineAnatomyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Congenital heart defects and skeletal malformations syndrome (CHDSKM) is a rare autosomal dominant disorder characterized by congenital heart disease, skeletal abnormalities, and failure to thrive. CHDSKM is caused by germline mutations in ABL1. To date, three variants have been in association with CHDSKM. In this study, we describe three de novo missense variants, c.407C>T (p.Thr136Met), c.746C>T (p.Pro249Leu), and c.1573G>A (p.Val525Met), and one recurrent variant, c.1066G>A (p.Ala356Thr), in six patients, thereby expanding the phenotypic spectrum of CHDSKM to include hearing impairment, lipodystrophy-like features, renal hypoplasia, and distinct ocular abnormalities. Functional investigation of the three novel variants showed an increased ABL1 kinase activity. The cardiac findings in additional patients with p.Ala356Thr contribute to the accumulating evidence that patients carrying either one of the recurrent variants, p.Tyr245Cys and p.Ala356Thr, have a high incidence of cardiac abnormalities. The phenotypic expansion has implications for the clinical diagnosis of CHDSKM in patients with germline ABL1 variants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,732
Score d'incertitude au seuil0,178

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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