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Enregistrement W3041437660 · doi:10.1371/journal.ppat.1008683

The Promyelocytic Leukemia Protein facilitates human herpesvirus 6B chromosomal integration, immediate-early 1 protein multiSUMOylation and its localization at telomeres

2020· article· en· W3041437660 sur OpenAlexafffund
Vanessa Collin, Annie Gravel, Benedikt B. Kaufer, Louis Flamand

Notice bibliographique

RevuePLoS Pathogens · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytomegalovirus and herpesvirus research
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPromyelocytic leukemia proteinSUMO proteinBiologyTelomereNuclear proteinCell biologyVirologyGeneticsDNAGeneTranscription factorUbiquitin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human herpesvirus 6B (HHV-6B) is a betaherpesvirus capable of integrating its genome into the telomeres of host chromosomes.Until now, the cellular and/or viral proteins facilitating HHV-6B integration have remained elusive.Here we show that a cellular protein, the promyelocytic leukemia protein (PML) that forms nuclear bodies (PML-NBs), associates with the HHV-6B immediate early 1 (IE1) protein at telomeres.We report enhanced levels of SUMOylated IE1 in the presence of PML and have identified a putative SUMO Interacting Motif (SIM) within IE1, essential for its nuclear distribution, overall SUMOylation and association with PML to nuclear bodies.Furthermore, using PML knockout cell lines we made the original observation that PML is required for efficient HHV-6B integration into host chromosomes.Taken together, we could demonstrate that PML-NBs are important for IE1 multiSU-MOylation and that PML plays an important role in HHV-6B integration into chromosomes, a strategy developed by this virus to maintain its genome in its host over long periods of time. Author summaryHuman herpesvirus 6B (HHV-6B) is a ubiquitous virus that can be life threatening in immunocompromised patients.HHV-6B is among a few other herpesviruses that integrate their genome in host chromosomes as a mean to establish dormancy.Integration of HHV-6B occurs in host telomeres, a region that protects our genome from deterioration and controls the cellular lifespan.To date, the mechanisms leading to HHV-6B integration remain elusive.Our laboratory has identified that the IE1 protein of HHV-6B associates with PML, a cellular protein that is responsible for the regulation of important cellular mechanisms including DNA recombination and repair.With the objective of understanding how IE1 is brought to PML, we discovered that PML aids the SUMOylation of IE1.This finding led us to identify a putative SUMO interaction motif on IE1 that

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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