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Enregistrement W3041444211 · doi:10.1007/s12161-020-01803-6

Strategy to Detect Genetically Modified Bacteria Carrying Tetracycline Resistance Gene in Fermentation Products

2020· article· en· W3041444211 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueFood Analytical Methods · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePharmaceutical and Antibiotic Environmental Impacts
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstituut voor Landbouw-, Visserij- en Voedingsonderzoek, Vlaamse OverheidFOD Volksgezondheid, Veiligheid van de Voedselketen en LeefmilieuUniversité Laval
Mots-clésTetracyclineBacteriaFermentationGenetically modified organismBiotechnologyMicrobiologyBiologyGeneChemistryFood scienceGeneticsAntibiotics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Unexpected contaminations of unauthorized genetically modified microorganisms (GMM) harbouring antimicrobial resistance (AMR) genes in food and feed enzymes, additives and flavourings commercialized on the European market have recently alerted the competent authorities regarding the food and feed safety. At the control level, we have therefore proposed a PCR-based strategy as first line screening targeting GMM carrying AMR genes in order to help enforcement laboratories. The potential presence of frequently used AMR genes is first investigated, using real-time PCR. In case of a suspicious matrix, the full-length of the detected AMR genes is then determined, using conventional PCR followed by Sanger sequencing, allowing to support the competent authorities in their evaluation related to potential health risks. In this study, PCR methods targeting an additional key AMR gene, being the tet-L gene (GenBank: D00946.1) conferring a resistance to tetracycline, were developed and successfully assessed in terms of specificity, sensitivity and applicability. In integrating these PCR methods, the proposed PCR-based strategy, initially targeting two key AMR genes conferring a resistance to chloramphenicol (GenBank: NC_002013.1) and kanamycin (GenBank: M19465.1), is consequently strengthened, allowing the coverage of a larger spectrum of potential GMM contaminations in microbial fermentation products.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,232
Score d'incertitude au seuil0,865

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,103
Tête enseignante GPT0,383
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle