MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3041543244 · doi:10.1002/mp.14385

External validation of a hidden Markov model for gamma‐based classification of anatomical changes in lung cancer patients using EPID dosimetry

2020· article· en· W3041543244 sur OpenAlexaffabout
Cecile J A Wolfs, Nicolas Varfalvy, Richard Canters, S. Nijsten, Djoya Hattu, Louis Archambault, Frank Verhaegen

Notice bibliographique

RevueMedical Physics · 2020
Typearticle
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueAdvanced Radiotherapy Techniques
Établissements canadiensUniversité LavalCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImage-guided radiation therapyNuclear medicineHistogramDosimetryRadiation therapyMedical imagingHidden Markov modelDose-volume histogramStandard deviationArtificial intelligencePattern recognition (psychology)MathematicsComputer scienceMedicineRadiation treatment planningRadiologyStatisticsImage (mathematics)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: To externally validate a hidden Markov model (HMM) for classifying gamma analysis results of in vivo electronic portal imaging device (EPID) measurements into different categories of anatomical change for lung cancer patients. Additionally, the relationship between HMM classification and deviations in dose-volume histogram (DVH) metrics was evaluated. METHODS: The HMM was developed at CHU de Québec (CHUQ), and trained on features extracted from gamma analysis maps of in vivo EPID measurements from 483 fractions (24 patients, treated with three-dimensional 3D-CRT or intensity modulated radiotherapy), using the EPID measurement of the first treatment fraction as reference. The model inputs were the average gamma value, standard deviation, and average value of the highest 1% of gamma values, all averaged over all beams in a fraction. The HMM classified each fraction into one of three categories: no anatomical change (Category 1), some anatomical change (no clinical action needed, Category 2) and severe anatomical change (clinical action needed, Category 3). The external validation dataset consisted of EPID measurements from 263 fractions of 30 patients treated at Maastro with volumetric modulated arc therapy (VMAT) or hybrid plans (containing both static beams and VMAT arcs). Gamma analysis features were extracted in the same way as in the CHUQ dataset, by using the EPID measurement of the first fraction as reference (γQ), and additionally by using an EPID dose prediction as reference (γM). For Maastro patients, cone beam computed tomography (CBCT) scans and image-guided radiotherapy (IGRT) classification of these images were available for each fraction. Contours were propagated from the planning CT to the CBCTs, and the dose was recalculated using a Monte Carlo dose engine. Dose-volume histogram metrics for targets and organs-at-risk (OARs: lungs, heart, mediastinum, spinal cord, brachial plexus) were extracted for each fraction, and compared to the planned dose. HMM classification of the external validation set was compared to threshold classification based on the average gamma value alone (a surrogate for clinical classification at CHUQ), IGRT classification as performed at Maastro, and differences in DVH metrics extracted from 3D dose recalculations on the CBCTs. RESULTS: The HMM achieved 65.4%/65.0% accuracy for γQ and γM, respectively, compared to average gamma threshold classification. When comparing HMM classification with IGRT classification, the overall accuracy was 29.7% for γQ and 23.2% for γM. Hence, HMM classification and IGRT classification of anatomical changes did not correspond. However, there is a trend towards higher deviations in DVH metrics with classification into higher categories by the HMM for large OARs (lungs, heart, mediastinum), but not for the targets and small OARs (spinal cord, brachial plexus). CONCLUSION: The external validation shows that transferring the HMM for anatomical change classification to a different center is challenging, but can still be valuable. The HMM trained at CHUQ cannot be used directly to classify anatomical changes in the Maastro data. However, it may be possible to use the model in a different capacity, as an indicator for changes in the 3D dose based on two-dimensional EPID measurements.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,009
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,034
Score d'incertitude au seuil0,068

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,009
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMedical PhysicsMême sujetAdvanced Radiotherapy TechniquesTravaux en français237 207