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Enregistrement W3041737028 · doi:10.5376/ijms.2020.10.0002

Cloning and Expression Analysis of Cdc25 Gene of <i>Sipunculus nudus</i> in Oocytes

2020· article· en· W3041737028 sur OpenAlexvenueno aff
Yonglin Su, Jianming Ye, Qi Liu, Yetao Zeng, Chengshu Zhang, Qingheng Wang

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Marine Science · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueReproductive Biology and Fertility
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyCdc25Open reading frameMolecular biologyUntranslated regionComplementary DNAGeneCell biologyPeptide sequenceGeneticsMessenger RNACyclin-dependent kinase 1Cell cycle

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cell division cycle 25 (Cdc25) is an important dual specificity phosphatase, which plays an important role in regulating the process of oocyte meiosis and embryo development. In this study, the full-length cDNA of Sn-Cdc25 was cloned from S. nudus using RACE technology. The results show that Sn-Cdc25 is 4 130 bp in length, including 3′ UTR 1 849 bp and 5′ UTR 427 bp. The Open reading frame (ORF) is 1 854 bp and encodes 617 amino acids. Sequence analysis shows that the molecular weight of Sn-Cdc25 protein is 69.58 kD, with two typical Cdc25 protein domains: M-phase inducer phosphatase domain and Rhodanese-like domain, and the active site sequence HCX 5 R that can catalyze the dephosphorylation process. Multi-sequence alignment finds that the C-terminal homology is higher than the N-terminal. The tertiary structure prediction shows that the spatial conformation of Cdc25 homologous protein and its active site are highly conservative. A total of 5 Motifs are found in Motif analysis, of which Motif 1 and Motif 2 are Paxillin LD motif and MYND domain binding motif, respectively. Phylogenetic tree analysis shows that Cdc25 is clustered into two branches: invertebrates and vertebrates. RT-PCR results show that the expression of Sn-Cdc25 , with two peaks, is significantly different in different developmental stages of oocytes. The increase in the expression of Sn-Cdc25 from primary vitellogenic stage to the late of active vitellogenic stage (O1-O3) may be related to the process of Sn-Cdc25 promoting DNA replication. When the oocytes entering metanephridium from coelomic fluid, the rapid rise of Sn-Cdc25 expression may be beneficial to the activation of maturation promoting factor (MPF). The above results have accumulated basic data for further understanding of the developmental mechanism of Sipuncula oocytes and for optimization of artificial breeding techniques.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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