MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3041762841 · doi:10.1155/2020/7093409

Chromosome 20p Partial <i>De Novo</i> Duplication Identified in a Female Paediatric Patient with Characteristic Facial Dysmorphism and Behavioural Anomalies

2020· article· en· W3041762841 sur OpenAlexaff
Shahzaib Khattak, Meryam Jan, S. A. Warsi, Sohail Khattak

Notice bibliographique

RevueCase Reports in Genetics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePediatric Hepatobiliary Diseases and Treatments
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineFacial dysmorphismGene duplicationGeneticsBiologyPhenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Copy number variations (CNVs) involving the JAG1 gene are rare and infrequently reported in the scientific literature. Recently, a generally healthy young patient presenting with a history of behavioural concerns was referred to us. Herein, we discuss the patient, a 7-year-old female possessing a 0.797 Mb microduplication within the short arm of chromosome 20 at band 12.2. The patient generates considerable curiosity due to the rarity of her case, which includes a de novo partial duplication involving the JAG1 gene. The patient exhibits a wide range of symptoms including facial dysmorphism (dolichocephaly, round face, tented philtrum, anteverted nares, and micrognathia), clinodactyly, and an inborn congenital heart defect. She presented with behavioural concerns including ADHD-I, SPD, motor clumsiness, and poor self-regulation. Deletions in JAG1 are often linked to Alagille Syndrome; however, complete duplications have not been specifically identified as disease-causing. JAG1 mutations are reported alongside various clinical features including facial dysmorphology, heart defects, vertebral abnormalities, and ocular dysmorphic features (strabismus, epicanthal folds, and slanted palpebral fissures). This particular microduplication is rare, and thus, limited data exist regarding its significance. To our knowledge, most reported duplications are larger than 0.797 Mb. This may define a critical region causing phenotypical changes in some patient cases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCase Reports in GeneticsMême sujetPediatric Hepatobiliary Diseases and TreatmentsTravaux en français237 207