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Enregistrement W3041990254 · doi:10.1111/pbi.13444

Base editing with high efficiency in allotetraploid oilseed rape by A3A‐PBE system

2020· article· en· W3041990254 sur OpenAlex
Hongtao Cheng, Mengyu Hao, Bingli Ding, Desheng Mei, Wenxiang Wang, Hui Wang, Rijin Zhou, Jia Liu, Chao Li, Qiong Hu

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevuePlant Biotechnology Journal · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaChinese Academy of Agricultural SciencesInstitute of GeneticsNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyBase (topology)BiotechnologyEvolutionary biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary CRISPR/Cas‐base editing is an emerging technology that could convert a nucleotide to another type at the target site. In this study, A3A‐PBE system consisting of human A3A cytidine deaminase fused with a Cas9 nickase and uracil glycosylase inhibitor was established and developed in allotetraploid Brassica napus . We designed three sgRNAs to target ALS , RGA and IAA7 genes, respectively. Base‐editing efficiency was demonstrated to be more than 20% for all the three target genes. Target sequencing results revealed that the editing window ranged from C1 to C10 of the PAM sequence. Base‐edited plants of ALS conferred high herbicide resistance, while base‐edited plants of RGA or IAA7 exhibited decreased plant height. All the base editing could be genetically inherited from T 0 to T 1 generation. Several Indel mutations were confirmed at the target sites for all the three sgRNAs. Furthermore, though no C to T substitution was detected at the most potential off‐target sites, large‐scale SNP variations were determined through whole‐genome sequencing between some base‐edited and wild‐type plants. These results revealed that A3A‐PBE base‐editing system could effectively convert C to T substitution with high‐editing efficiency and broadened editing window in oilseed rape. Mutants for ALS , IAA7 and RGA genes could be potentially applied to confer herbicide resistance for weed control or with better plant architecture suitable for mechanic harvesting.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,043
Score d'incertitude au seuil0,668

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle