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Enregistrement W3042086219 · doi:10.1002/cre2.301

Mandibular undifferentiated pleomorphic sarcoma: Molecular analysis of a primary cell population

2020· article· en· W3042086219 sur OpenAlexaff
Hope M. Amm, Patricia DeVilliers, Ambika R. Srivastava, Marina Gonçalves Diniz, Gene P. Siegal, Mary MacDougall

Notice bibliographique

RevueClinical and Experimental Dental Research · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSarcoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Dental and Craniofacial Research
Mots-clésVimentinPathologyBiologySarcomaPopulationUndifferentiated Pleomorphic SarcomaMesenchymal stem cellImmunohistochemistrySoft tissue sarcomaMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Undifferentiated pleomorphic sarcomas are one of the most common subtypes of soft tissue sarcomas. These are aggressive mesenchymal tumors and are devoid of the major known biomarkers except vimentin. Our objective was to establish and characterize a primary cell population from a mandibular UPS specimen. METHODS: The tumor was surgically removed from the right mandible of a 24-year-old male with IRB approved signed consent. Tumor was dissected, cultured ex vivo, and a cell population, MUPS-1, were isolated from outgrowths. Gene and protein expression profiles of both the primary tumor and the derived there from cells were obtained by quantitative RT-PCR and immunohistochemistry and included markers of epithelial, endothelial, and mesenchymal differentiation. To better define potential biomarkers, MUPS-1 cells were additionally characterized by RNA sequencing analysis. RESULTS: Pathological analysis of primary tumor tissue revealed a sarcoma demonstrating multiple pathways of differentiation simultaneously with myxoid, fibrous, and osseous tissue. The isolated cells had a spindle cell-like morphology, were maintained in culture for greater than 20 passages, and formed colonies in soft agar indicating tumorigenicity. The cells, similar to the primary tumor, were strongly positive for vimentin and moderately expressed alkaline phosphatase. RNA-seq analysis revealed the tumor over-expressed several genes compared to normal tissue, including components of the Notch signaling pathway, NOTCH3 and JAG1. CONCLUSIONS: We have successfully established an undifferentiated pleomorphic sarcoma cell population, which will provide a valuable resource for studying fundamental processes and potentially serving as a platform for exploring therapeutic strategies for sarcomas.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,454

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,145
Tête enseignante GPT0,440
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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