Role of the small GTPase activating protein IQGAP1 in collagen phagocytosis
Notice bibliographique
Résumé
Many adult connective tissues undergo continuous remodeling to maintain matrix homeostasis. Physiological remodeling involves the degradation of collagen fibers by the intracellular cathepsin-dependent phagocytic pathway. We considered that a multidomain, small GTPase activating protein, IQGAP1, which is involved in the generation of cell extensions, is required for collagen phagocytosis, possibly arising from its interactions with cdc42 and the actin-binding protein Flightless I (FliI). We examined the role of IQGAP1 in collagen phagocytosis by human gingival fibroblasts (HGFs) and by IQGAP1+/+ and IQGAP1-/- mouse embryonic fibroblasts. IQGAP1 was strongly expressed by HGFs, localized to vinculin-stained cell adhesions and sites where cell extensions are initiated, and colocalized with FliI. Immunoprecipitation showed that IQGAP1 associated with FliI. HGFs showed 10-fold increases of collagen binding, 6-fold higher internalization, and 3-fold higher β1 integrin activation between 30 and 180 min after incubation with collagen. Compared with IQGAP1+/+ fibroblasts, deletion of IQGAP1 reduced collagen binding (1.4-fold), collagen internalization (3-fold), β1 integrin activation (2-fold), and collagen degradation (1.8-fold). We conclude that IQGAP1 affects collagen remodeling through its regulation of phagocytic degradation pathways, which may involve the interaction of IQGAP1 with FliI.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».