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Enregistrement W3042162368 · doi:10.1002/jcp.29933

Role of the small GTPase activating protein IQGAP1 in collagen phagocytosis

2020· article· en· W3042162368 sur OpenAlexafffund
Kei Nakajima, Pamela D. Arora, Ajay Plaha, Christopher A. McCulloch

Notice bibliographique

RevueJournal of Cellular Physiology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesInstitute of Musculoskeletal Health and ArthritisCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésIQGAP1Cell biologyInternalizationPhagocytosisSmall GTPaseChemistryBiologyScaffold proteinSignal transductionCellBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Many adult connective tissues undergo continuous remodeling to maintain matrix homeostasis. Physiological remodeling involves the degradation of collagen fibers by the intracellular cathepsin-dependent phagocytic pathway. We considered that a multidomain, small GTPase activating protein, IQGAP1, which is involved in the generation of cell extensions, is required for collagen phagocytosis, possibly arising from its interactions with cdc42 and the actin-binding protein Flightless I (FliI). We examined the role of IQGAP1 in collagen phagocytosis by human gingival fibroblasts (HGFs) and by IQGAP1+/+ and IQGAP1-/- mouse embryonic fibroblasts. IQGAP1 was strongly expressed by HGFs, localized to vinculin-stained cell adhesions and sites where cell extensions are initiated, and colocalized with FliI. Immunoprecipitation showed that IQGAP1 associated with FliI. HGFs showed 10-fold increases of collagen binding, 6-fold higher internalization, and 3-fold higher β1 integrin activation between 30 and 180 min after incubation with collagen. Compared with IQGAP1+/+ fibroblasts, deletion of IQGAP1 reduced collagen binding (1.4-fold), collagen internalization (3-fold), β1 integrin activation (2-fold), and collagen degradation (1.8-fold). We conclude that IQGAP1 affects collagen remodeling through its regulation of phagocytic degradation pathways, which may involve the interaction of IQGAP1 with FliI.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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