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Enregistrement W3042549515 · doi:10.3747/co.27.5861

Validation in Alberta of an Administrative Data Algorithm to Identify Cancer Recurrence

2020· article· en· W3042549515 sur OpenAlexafffundvenueabout
Zoe F. Cairncross, Gregg Nelson, Lorraine Shack, Amy Metcalfe

Notice bibliographique

RevueCurrent Oncology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Risks and Factors
Établissements canadiensAlberta Health ServicesAlberta Cancer FoundationUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMedicineConfidence intervalMedical diagnosisChartKappaGold standard (test)AlgorithmCancer registryCancerPopulationPredictive valueDiagnosis codeGynecologyObstetricsPediatricsInternal medicineStatisticsRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Readily available population-based data about cancer recurrence would improve surveillance and research for women of reproductive age. Methods: We randomly selected 200 women from the Alberta Cancer Registry who had received a cancer diagnosis and who ever had a pregnancy between 2003 and 2012. Administrative data were obtained and linked. Several definitions of recurrence were assessed using various minimum lengths of time between the initial diagnosis date and subsequent diagnoses or treatments, or both. Chart review was used as a "gold standard" definition of recurrence. Results: Chart review identified recurrences in 26 women. The definition that best captured "recurrence" was 2 or more cancer diagnosis codes 10 or more months from the diagnosis date [sensitivity: 80.8%; 95% confidence interval (ci): 60.7% to 93.5%; specificity: 81.0%; 95% ci: 74.4% to 86.6%; positive predictive value: 38.9%; 95% ci: 25.9% to 53.1%; negative predictive value: 96.6%; 95% ci: 92.2% to 98.9%; kappa = 0.42; 95% ci: 0.28 to 0.57]. Conclusions: Recurrence in reproductive-aged women can be captured with moderate validity using administrative data, but should be interpreted with caution.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,019
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,069
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,981
Score d'incertitude au seuil0,956

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0190,069
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0050,004
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,385
Tête enseignante GPT0,554
Écart entre enseignants0,168 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
DomaineMéthodes
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2020
Routes d'admission4
Résumé présentoui

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