Integrated Approaches in Support of Taxonomic Identification of Mosquitoes (Diptera: Culicidae) in Vector Surveillance in Spain
Notice bibliographique
Résumé
The pandemic of Zika virus in 2016 and other arboviruses prompted La Rioja Government in Spain to implement an entomological surveillance program of mosquitoes (Diptera; Culicidae) in the region of La Rioja. The morphological identification was supported by genetic analysis using the COI (cytochrome c oxidase subunit I) and the ITS2 (internal transcribed spacer 2) genes. In total, we identified 24 species arranged in 6 genera: Aedes (7 species), Anopheles (4 species), Coquillettidia (1 species), Culex (7 species), Culiseta (4 species), and Uranotaenia (1 species). Aedes sticticus and Aedes geniculatus are newly reported for La Rioja region. In total, 465 COI sequences were analyzed for Culicinae and Anophelinae and 54 ITS2 sequences for Anophelinae; all individuals identified as the same species clustered together in the Neighbor Joining trees. The levels of sequence divergence based on COI ranged between 0% and 2.62%, while the interspecific genetic divergence ranged from 3.05% to 20.07%. Within the genus Culiseta, certain specimens of Culiseta annulata , Culiseta litorea, and Culiseta subochrea were morphologically misidentified due to variation in the main diagnostic characters. The interspecific genetic divergence based on the ITS2 ranged from 0% to 2.98%. An accurate identification of mosquito vectors is the first step to establish a vector surveillance program for preventing pathogen transmission.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».