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Enregistrement W3042948013 · doi:10.1101/2020.07.17.208421

Coffee consumption and risk of breast cancer: a Mendelian Randomization study

2020· preprint· en· W3042948013 sur OpenAlexfundno aff
Merete Ellingjord‐Dale, Nikos Papadimitriou, Michail Katsoulis, Chew Yee, Niki Dimou, Dipender Gill, Dagfinn Aune, Jue‐Sheng Ong, Stuart MacGregor, Benjamin Elsworth, Sarah Lewis, Richard M. Martin, Elio Ríboli, Konstantinos K. Tsilidis

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCoffee research and impacts
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesWorld Cancer Research FundMedical Research CouncilUniversity of BristolNational Institutes of HealthUniversity Hospitals Bristol NHS Foundation TrustCancer Research UKGovernment of CanadaWorld Cancer Research Fund InternationalCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute for Health and Care ResearchGenome Canada
Mots-clésMendelian randomizationBreast cancerMedicineConfidence intervalOdds ratioInternal medicineOncologyEstrogen receptorSingle-nucleotide polymorphismGynecologyCancerDemographyGenotypeGeneticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Observational studies have reported either null or weak protective associations for coffee consumption and risk of breast cancer. Methods We conducted a two-sample Mendelian randomization randomization (MR) analysis to evaluate the relationship between coffee consumption and breast cancer risk using 33 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) associated with coffee consumption from a genome-wide association (GWA) study on 212,119 female UK Biobank participants of White British ancestry. Risk estimates for breast cancer were retrieved from publicly available GWA summary statistics from the Breast Cancer Association Consortium (BCAC) on 122,977 cases (of which 69,501 were estrogen receptor (ER)-positive, 21,468 ER-negative) and 105,974 controls of European ancestry. Random-effects inverse variance weighted (IVW) MR analyses were performed along with several sensitivity analyses to assess the impact of potential MR assumption violations. Results One cup per day increase in genetically predicted coffee consumption in women was not associated with risk of total (IVW random-effects; odds ratio (OR): 0.91, 95% confidence intervals (CI): 0.80-1.02, P: 0.12, P for instrument heterogeneity: 7.17e-13), ER-positive (OR=0.90, 95% CI: 0.79-1.02, P: 0.09) and ER-negative breast cancer (OR: 0.88, 95% CI: 0.75-1.03, P: 0.12). Null associations were also found in the sensitivity analyses using MR-Egger (total breast cancer; OR: 1.00, 95% CI: 0.80-1.25), weighted median (OR: 0.97, 95% CI: 0.89-1.05) and weighted mode (OR: 1.00, CI: 0.93-1.07). Conclusions The results of this large MR study do not support an association of genetically predicted coffee consumption on breast cancer risk, but we cannot rule out existence of a weak inverse association.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,254
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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