Coffee consumption and risk of breast cancer: a Mendelian Randomization study
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Observational studies have reported either null or weak protective associations for coffee consumption and risk of breast cancer. Methods We conducted a two-sample Mendelian randomization randomization (MR) analysis to evaluate the relationship between coffee consumption and breast cancer risk using 33 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) associated with coffee consumption from a genome-wide association (GWA) study on 212,119 female UK Biobank participants of White British ancestry. Risk estimates for breast cancer were retrieved from publicly available GWA summary statistics from the Breast Cancer Association Consortium (BCAC) on 122,977 cases (of which 69,501 were estrogen receptor (ER)-positive, 21,468 ER-negative) and 105,974 controls of European ancestry. Random-effects inverse variance weighted (IVW) MR analyses were performed along with several sensitivity analyses to assess the impact of potential MR assumption violations. Results One cup per day increase in genetically predicted coffee consumption in women was not associated with risk of total (IVW random-effects; odds ratio (OR): 0.91, 95% confidence intervals (CI): 0.80-1.02, P: 0.12, P for instrument heterogeneity: 7.17e-13), ER-positive (OR=0.90, 95% CI: 0.79-1.02, P: 0.09) and ER-negative breast cancer (OR: 0.88, 95% CI: 0.75-1.03, P: 0.12). Null associations were also found in the sensitivity analyses using MR-Egger (total breast cancer; OR: 1.00, 95% CI: 0.80-1.25), weighted median (OR: 0.97, 95% CI: 0.89-1.05) and weighted mode (OR: 1.00, CI: 0.93-1.07). Conclusions The results of this large MR study do not support an association of genetically predicted coffee consumption on breast cancer risk, but we cannot rule out existence of a weak inverse association.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,028 | 0,082 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».