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Enregistrement W3043001822 · doi:10.1186/s12911-020-01182-2

Validation of an EMR algorithm to measure the prevalence of ADHD in the Canadian Primary Care Sentinel Surveillance Network (CPCSSN)

2020· article· en· W3043001822 sur OpenAlexafffundabout
Rachael Morkem, Kenneth Handelman, John Queenan, Richard Birtwhistle, David Barber

Notice bibliographique

RevueBMC Medical Informatics and Decision Making · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAttention Deficit Hyperactivity Disorder
Établissements canadiensHealth Sciences CentreQueen's University
Organismes subventionnairesShire Canada
Mots-clésHealth informaticsPrimary careMeasure (data warehouse)MedicineAlgorithmFamily medicineComputer scienceData miningPublic healthNursing

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Building and validating electronic algorithms to identify patients with specific disease profiles using health data is becoming increasingly important to disease surveillance and population health management. The aim of this study was to develop and validate an algorithm to find patients with ADHD diagnoses within primary care electronic medical records (EMR); and then use the algorithm to describe the epidemiology of ADHD from 2008 to 2015 in a Canadian Primary care sample. METHODS: This was a cross sectional time series that used data from the Canadian Primary Care Sentinel Surveillance Network (CPCSSN), a repository of primary care EMR data. A sample of electronic patient charts from one local clinic were manually reviewed to determine the positive predictive value (PPV) and negative predictive value (NPV) of an ADHD case-finding algorithm. In each study year a practice population was determined, and the algorithm was used to measure an observed prevalence of ADHD. The observed prevalence was adjusted for misclassification, as measured by the validity indices, to obtain an estimate of the true prevalence. Estimates were calculated by age group (4-17 year olds, 18 to 34 year olds, and 35 to 64 year olds) and gender, and compared over time. RESULTS: The EMR algorithm had a PPV of 98.0% (95% CI [92.5, 99.5]) and an NPV of 95.0% (95% CI [92.9, 98.6]). After adjusting for misclassification, it was determined that the prevalence of patients with a clinical diagnosis of ADHD has risen in all age groups between 2008 and 2015, most notably in children and young adults (6.92, 95% CI [5.62, 8.39] to 8.57, 95% CI [7.32, 10.00]; 5.73, 95% CI [4.40, 7.23] to 7.33, 95% CI [6.04, 8.78], respectively). The well-established gender gap persisted in all age groups across time but was considerably smaller in older adults compared to children and young adults. CONCLUSION: Overall, the ADHD case-finding algorithm was found to be a valid tool to assess the epidemiology of ADHD in Canadian primary care practice. The increased prevalence of ADHD between 2008 and 2015 may reflect an improvement in the recognition and treatment of this disorder within primary care.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,038
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,110
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,689
Score d'incertitude au seuil0,619

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0380,110
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0040,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,071
Tête enseignante GPT0,341
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2020
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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