<i>Parastagonospora nodorum</i> and Related Species in Western Canada: Genetic Variability and Effector Genes
Notice bibliographique
Résumé
Parastagonospora nodorum is an important fungal pathogen that causes Septoria nodorum blotch (SNB) in wheat. This pathogen produces several necrotrophic effectors that act as virulence factors; three have been cloned, SnToxA, SnTox1, and SnTox3. In this study, P. nodorum and its sister species P. avenaria f. tritici (Pat1) were isolated from wheat node and grain samples collected from distanced sites in western Canada during 2018. The presence of effector genes and associated haplotypes were determined by PCR and sequence analysis. An internal transcribed spacer-restriction fragment length polymorphism test was developed to distinguish between leaf spotting pathogens (P. nodorum, Pat1, Pyrenophora tritici-repentis, and Bipolaris sorokiniana). P. nodorum was mainly recovered from wheat nodes and to a lesser extent from the grains, while Pat1 was exclusively isolated from grain samples. The effector genes were present in almost all P. nodorum isolates, with the ToxA haplotype 5 (H5) being most prevalent, while a novel ToxA haplotype (denoted here H21) is reported for the first time. In Pat1, only combinations of SnTox1 and SnTox3 genes were present. A ToxA haplotype network was also constructed to assess the evolutionary relationship among globally found haplotypes to date. Finally, cultivars representing wheat development in Canada for the last century were tested for sensitivity to Sn-effectors and to the presence of Tsn1, the ToxA sensitivity gene. Of tested cultivars, 32.9 and 56.9% were sensitive to SnTox1 and SnTox3, respectively, and Tsn1 was present in 59% of the cultivars. In conclusion, P. nodorum and Pat1 were prevalent wheat pathogens in Canada with a potential tissue-specific colonization capacity, while producing necrotrophic effectors to which wheat is sensitive.
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».