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Enregistrement W3043285927 · doi:10.1164/rccm.202001-0197oc

Evidence for Environmental–Human Microbiota Transfer at a Manufacturing Facility with Novel Work-related Respiratory Disease

2020· article· en· W3043285927 sur OpenAlexaff
Benjamin G. Wu, Bianca Kapoor, Kristin J. Cummings, Marcia Stanton, Randall J. Nett, Kathleen Kreiss, Jerrold L. Abraham, Thomas V. Colby, Angela Franko, Francis H. Y. Green, Soma Sanyal, José C. Clemente, Zhan Gao, Maryaline Coffre, Peter Meyn, Adriana Heguy, Yonghua Li, Imran Sulaiman, Timothy C. Borbet, Sergei B. Koralov, Robert J. Tallaksen, Douglas Wendland, Vance D. Bachelder, Randy Boylstein, Ju‐Hyeong Park, Jean M. Cox‐Ganser, M. Abbas Virji, Judith A. Crawford, Nicole Edwards, Marc Veillette, Caroline Duchaine, Krista Warren, Sarah Lundeen, Martin J. Blaser, Leopoldo N. Segal

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Respiratory and Critical Care Medicine · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueIndoor Air Quality and Microbial Exposure
Établissements canadiensUniversité LavalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute of General Medical SciencesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Cancer InstituteNational Heart, Lung, and Blood Institute
Mots-clésMedicineLungRespiratory systemRespiratory diseaseRespiratory tractPathologyImmunologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Rationale Workers’ exposure to metalworking fluid (MWF) has been associated with respiratory disease. Objectives As part of a public health investigation of a manufacturing facility, we performed a cross-sectional study using paired environmental and human sampling to evaluate the cross-pollination of microbes between the environment and the host and possible effects on lung pathology present among workers. Methods Workplace environmental microbiota were evaluated in air and MWF samples. Human microbiota were evaluated in lung tissue samples from workers with respiratory symptoms found to have lymphocytic bronchiolitis and alveolar ductitis with B-cell follicles and emphysema, in lung tissue samples from control subjects, and in skin, nasal, and oral samples from 302 workers from different areas of the facility. In vitro effects of MWF exposure on murine B cells were assessed. Measurements and Main Results An increased similarity of microbial composition was found between MWF samples and lung tissue samples of case workers compared with control subjects. Among workers in different locations within the facility, those that worked in the machine shop area had skin, nasal, and oral microbiota more closely related to the microbiota present in the MWF samples. Lung samples from four index cases and skin and nasal samples from workers in the machine shop area were enriched with Pseudomonas, the dominant taxa in MWF. Exposure to used MWF stimulated murine B-cell proliferation in vitro, a hallmark cell subtype found in the pathology of index cases. Conclusions Evaluation of a manufacturing facility with a cluster of workers with respiratory disease supports cross-pollination of microbes from MWF to humans and suggests the potential for exposure to these microbes to be a health hazard.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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