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Enregistrement W3043375436 · doi:10.1371/journal.pcbi.1007857

Towards optogenetic vision restoration with high resolution

2020· article· en· W3043375436 sur OpenAlexfundno aff
Ulisse Ferrari, Stéphane Deny, Abhishek Sengupta, Romain Caplette, Francesco Trapani, José‐Alain Sahel, Deniz Dalkara, Serge Picaud, Jens Duebel, Olivier Marre

Notice bibliographique

RevuePLoS Computational Biology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiquePhotoreceptor and optogenetics research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeHorizon 2020 Framework ProgrammeEuropean Research CouncilNational Institutes of HealthAgence Nationale de la RechercheFoundation Fighting BlindnessAlliance Nationale pour les Sciences de la Vie et de la Santé
Mots-clésOptogeneticsNeuroscienceRetinaReceptive fieldPopulationChannelrhodopsinRetinal ganglion cellBiologyAxonPhotic StimulationMedicineVisual perception

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In many cases of inherited retinal degenerations, ganglion cells are spared despite photoreceptor cell death, making it possible to stimulate them to restore visual function. Several studies have shown that it is possible to express an optogenetic protein in ganglion cells and make them light sensitive, a promising strategy to restore vision. However the spatial resolution of optogenetically-reactivated retinas has rarely been measured, especially in the primate. Since the optogenetic protein is also expressed in axons, it is unclear if these neurons will only be sensitive to the stimulation of a small region covering their somas and dendrites, or if they will also respond to any stimulation overlapping with their axon, dramatically impairing spatial resolution. Here we recorded responses of mouse and macaque retinas to random checkerboard patterns following an in vivo optogenetic therapy. We show that optogenetically activated ganglion cells are each sensitive to a small region of visual space. A simple model based on this small receptive field predicted accurately their responses to complex stimuli. From this model, we simulated how the entire population of light sensitive ganglion cells would respond to letters of different sizes. We then estimated the maximal acuity expected by a patient, assuming it could make an optimal use of the information delivered by this reactivated retina. The obtained acuity is above the limit of legal blindness. Our model also makes interesting predictions on how acuity might vary upon changing the therapeutic strategy, assuming an optimal use of the information present in the retinal activity. Optogenetic therapy could thus potentially lead to high resolution vision, under conditions that our model helps to determinine.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,241
Score d'incertitude au seuil0,371

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,074
Tête enseignante GPT0,326
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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