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Enregistrement W3043409543 · doi:10.2196/20160

Chronic Kidney Disease in Tasmania: Protocol for a Data Linkage Study

2020· article· en· W3043409543 sur OpenAlexvenueno aff
Timothy Saunder, Alex Kitsos, Jan Radford, Kim Jose, Charlotte McKercher, R. Raj, Nadine Wiggins, Brian Stokes, Matthew Jose

Notice bibliographique

RevueJMIR Research Protocols · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Kidney Disease and Diabetes
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Coronial Information SystemTasmanian Community Fund
Mots-clésKidney diseaseProtocol (science)Linkage (software)MedicineAlternative medicineGeneticsInternal medicineBiologyPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Chronic kidney disease (CKD) is a significant and growing health burden globally. Tasmania has the highest state prevalence for non-Indigenous Australians and it has consistently had the lowest incidence and prevalence of dialysis in Australia. Objective To examine the gap between the high community prevalence of CKD in Tasmania and the low use of dialysis. Methods This is a retrospective cohort study using linked data from 5 health and 2 pathology data sets from the island state of Tasmania, Australia. The study population consists of any person (all ages including children) who had a blood measurement of creatinine with the included pathology providers between January 1, 2004, and December 31, 2017. This study population (N=460,737) includes within it a CKD cohort, which was detected via pathology or documentation of kidney replacement therapy (KRT; dialysis or kidney transplant). Kidney function (estimated glomerular filtration rate [eGFR]) was calculated using the Chronic Kidney Disease Epidemiology Collaboration (CKD-EPI) formula. Individuals with 2 measures of eGFR<60 mL/min/1.73 m2, at least 90 days apart, were identified as having CKD and were included in the CKD cohort. Individuals treated with dialysis or transplant were identified from the Australia and New Zealand Dialysis and Transplant Registry. Results The study population consisted of 460,737 people (n=245,573 [53.30%] female, mean age 47.4 years) who were Tasmanian residents aged 18 years and older and were followed for a median of 7.8 years. During the later 5 years of the study period, 86.79% (355,622/409,729) of Tasmanian adults were represented. The CKD cohort consisted of 56,438 people (ie, 12.25% of the study population; 53.87% (30,405/56,438) female, mean age 69.9 years) followed for a median of 10.4 years with 56,039 detected via eGFR and 399 people detected via documentation of KRT. Approximately half (227,433/460,737, 49.36%) of the study population and the majority of the CKD cohort (41,448/56,438, 73.44%) had an admission episode. Of the 55,366 deaths recorded in the study population, 45.10% (24,970/55,366) had CKD. Conclusions Whole-of-population approaches to examine CKD in the community can be achieved by data linkage. Over this 14-year period, CKD affected 12.25% (56,438/460,737) of Tasmanian adult residents and was present in 45.10% (24,970/55,366) of deaths. International Registered Report Identifier (IRRID) DERR1-10.2196/20160

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,046
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,056
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,051
Score d'incertitude au seuil0,242

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0460,056
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,003
Bibliométrie0,0040,007
Études des sciences et des technologies0,0040,001
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0030,003
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0510,007

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,444
Tête enseignante GPT0,589
Écart entre enseignants0,145 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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