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Enregistrement W3043435386 · doi:10.1038/s41467-020-17064-0

PRDM15 is a key regulator of metabolism critical to sustain B-cell lymphomagenesis

2020· article· en· W3043435386 sur OpenAlexafffund
Slim Mzoughi, Jia Yi Fong, David Papadopoli, Cheryl M. Koh, Laura Hulea, Paolo Pigini, Federico Di Tullio, Giuseppe Andreacchio, Michał Marek Hoppe, Heike Wollmann, Diana Low, Matias J. Caldez, Yanfen Peng, Denis Torre, Julia N. Zhao, Oro Uchenunu, Gabriele Varano, Corina-Mihaela Motofeanu, Manikandan Lakshmanan, Shun Xie Teo, Cheng Mun Wun, Giovanni Perini, Soo‐Yong Tan, Chee Bing Ong, Muthafar Al‐Haddawi, Ravisankar Rajarethinam, Susan Swee‐Shan Hue, Soon Thye Lim, Choon Kiat Ong, Dachuan Huang, Siok‐Bian Ng, Emily Bernstein, Dan Hasson, Keng Boon Wee, Philipp Kaldis, Anand D. Jeyasekharan, David Dominguez-Sola, Ivan Topisirović, Ernesto Guccione

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensUniversité de MontréalHôpital Maisonneuve-RosemontMcGill University
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteBiomedical Research CouncilNational Medical Research CouncilFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchTerry Fox FoundationNational Institutes of HealthMedical Research CouncilTerry Fox Research InstituteAgency for Science, Technology and ResearchInstitute of Molecular and Cell BiologyDeutsches KrebsforschungszentrumCenter for Strategic Scientific Initiatives, National Cancer InstituteMcGill UniversityTanoto FoundationIcahn School of Medicine at Mount Sinai
Mots-clésRegulatorKey (lock)Cell metabolismComputational biologyCell biologyBiologyCellGeneticsGeneEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PRDM (PRDI-BF1 and RIZ homology domain containing) family members are sequence-specific transcriptional regulators involved in cell identity and fate determination, often dysregulated in cancer. The PRDM15 gene is of particular interest, given its low expression in adult tissues and its overexpression in B-cell lymphomas. Despite its well characterized role in stem cell biology and during early development, the role of PRDM15 in cancer remains obscure. Herein, we demonstrate that while PRDM15 is largely dispensable for mouse adult somatic cell homeostasis in vivo, it plays a critical role in B-cell lymphomagenesis. Mechanistically, PRDM15 regulates a transcriptional program that sustains the activity of the PI3K/AKT/mTOR pathway and glycolysis in B-cell lymphomas. Abrogation of PRDM15 induces a metabolic crisis and selective death of lymphoma cells. Collectively, our data demonstrate that PRDM15 fuels the metabolic requirement of B-cell lymphomas and validate it as an attractive and previously unrecognized target in oncology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations49
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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