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Enregistrement W3043627474 · doi:10.4103/0972-9062.289398

A novel quinoline-appended chalcone derivative as potential Plasmodium falciparum gametocytocide

2019· article· en· W3043627474 sur OpenAlexaff
SujitKumar Ghosh, Himank Kumar, Ishan Wadi, Vinod Devaraji, C. R. Pillai

Notice bibliographique

RevueJournal of Vector Borne Diseases · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMalaria Research and Control
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGametocytePlasmodium falciparumVirtual screeningProtein Data Bank (RCSB PDB)Docking (animal)ChalconeLigand (biochemistry)Computational biologyMalariaChemistryBiologyCombinatorial chemistryDrug discoveryBiochemistryStereochemistryMedicineImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND & OBJECTIVES: Malaria has remained a global health problem despite the effective control and treatment measures. In the backdrop of drug resistance, developing novel hybrid molecules targeting the sexual stages (gametocytes) of the human malaria parasite Plasmodium falciparum is of great significance. Recently, chalcone- based polyphenols have generated a great interest in the malaria research community worldwide due to their ease of synthesis and significant biological activity. The primary objective of this study was to investigate the interaction of a newly synthesized quinoline-appended chalcone derivative (ADMQ) with gametocyte specific proteins, Pfg 27 and Pfs 25 and explore its in vitro gametocytocidal potential. METHODS: The characterization of ligand-protein interactions at the atomistic level was done by a simulation strategy that combines molecular docking and molecular dynamics (MD) simulation in a coherent workflow. The X-ray crystal structure of Pfg 27 was retrieved from protein data bank and Pfs 25 was built using the Iterative Threading ASSembly Refinement (I-TASSER) server. The detailed interaction of both ADMQ and a known gametocytocidal agent, methylene blue (MB) (used as a positive control) with gametocyte proteins Pfg 27 and Pfs 25 was studied with a 50 ns explicit MD simulation. The ligand binding pose in terms of glide score, molecular mechanics-generalized born surface area (MM-GBSA) binding energies, protein-ligand root-mean-square-deviation (RMSD) and secondary structure elements (SSE) changes were analyzed accordingly. The direct effect of ADMQ on structural integrity of P. falciparum gametocytes was also examined using in vitro microscopy. RESULTS: The analogous Glide score and MM-GBSA free energy of binding indicated stable interactions for both ADMQ and MB harboured in the active site of targeted gametocyte proteins, Pfg 27 and Pfs 25, separately. Explicit MD simulation by Desmond software package indicated similar distinguishable conformational changes in the active site of target polypeptide chain due to the specific accommodation of ADMQ molecule. The simulation also manifested comparable mechanistic profile in terms of protein-ligand RMSD and changes in secondary structure elements (SSE). Further, ADMQ treatment was found to adversely affect the structural integrity of gametocytes, which resulted in appearance of vesicles protruding from the gametocytes. INTERPRETATION & CONCLUSION: The consolidated in silico molecular modeling and in vitro study described herein may give an insight into the interaction patterns of quinoline-chalcone hybrids with critical gametocyte proteins in the mosquito. This study will possibly pave the way for further exploration of similar heterocyclic quinoline-chalcone hybrids to open up new avenues in drug candidate development against P. falciparum gametocytes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,904
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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