Abnormal Food Timing Promotes Alcohol-Associated Dysbiosis and Colon Carcinogenesis Pathways
Notice bibliographique
Résumé
Background: Alcohol consumption is an established risk factor for colon cancer (CRC). Identifying cofactor(s) that modulate the effect of alcohol on colon inflammation and carcinogenesis could help risk stratification for CRC. Disruption of circadian rhythm by light/dark shift, promotes alcohol-induced colonic inflammation and cancer. More recently, we found that abnormal food timing causes circadian rhythm disruption and promotes alcohol associated colon carcinogenesis. In this study, we examined the interaction of wrong time feeding (WTF) and alcohol on CRC-related pathways, in relation to changes in microbial community structure. Method: Polyposis mice (TS4Cre x cAPCΔ468) underwent four conditions: Alcohol or Water and feeding during the light (wrong-time fed/WTF) or during the dark (right-time fed/RTF). Colonic cecum mucosal gene expression was analysed by RNA-seq. Microbiota 16S ribosomal RNA sequencing analysis was used to examine colonic feces. Modelling was used to estimate the extent of the gene expression changes that could be related to the changes in the colonic microbial composition. Results: The circadian rhythm pathway was the most altered pathway by the WTF treatment, indicating that WTF is disruptive to the colonic circadian rhythm. Pathway analysis revealed interaction of WTF with alcohol in dysregulating pathways related to colon carcinogenesis. Similarly, the interaction of alcohol and WTF was detected at multiple parameters of the colonic microbiota including alpha- and beta-diversity, as well as the community structure. Our modelling revealed that almost a third of total gene alterations induced by our treatments could be related to alterations in the abundance of the microbial taxa. Conclusion: These data support the promoting effect of abnormal food timing alcohol-associated CRC related pathways in the colon, and suggests colon dysbiosis as a targetable mechanism.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».