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Enregistrement W3043628497 · doi:10.3389/fonc.2020.01029

Abnormal Food Timing Promotes Alcohol-Associated Dysbiosis and Colon Carcinogenesis Pathways

2020· article· en· W3043628497 sur OpenAlexaff
Faraz Bishehsari, Shirin Moossavi, Phillip A. Engen, Xiaohan Liu, Yue Zhang

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Oncology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDiet and metabolism studies
Établissements canadiensUniversity of ManitobaChildren's Hospital Research Institute of Manitoba
Organismes subventionnairesUniversity of Illinois at Urbana-ChampaignNational Institutes of HealthNational Institute on Alcohol Abuse and AlcoholismSwim Across AmericaRush University
Mots-clésDysbiosisCarcinogenesisCancer researchMedicineColorectal cancerSignal transductionBioinformaticsInternal medicineBiologyOncologyMicrobiomeGeneticsCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Alcohol consumption is an established risk factor for colon cancer (CRC). Identifying cofactor(s) that modulate the effect of alcohol on colon inflammation and carcinogenesis could help risk stratification for CRC. Disruption of circadian rhythm by light/dark shift, promotes alcohol-induced colonic inflammation and cancer. More recently, we found that abnormal food timing causes circadian rhythm disruption and promotes alcohol associated colon carcinogenesis. In this study, we examined the interaction of wrong time feeding (WTF) and alcohol on CRC-related pathways, in relation to changes in microbial community structure. Method: Polyposis mice (TS4Cre x cAPCΔ468) underwent four conditions: Alcohol or Water and feeding during the light (wrong-time fed/WTF) or during the dark (right-time fed/RTF). Colonic cecum mucosal gene expression was analysed by RNA-seq. Microbiota 16S ribosomal RNA sequencing analysis was used to examine colonic feces. Modelling was used to estimate the extent of the gene expression changes that could be related to the changes in the colonic microbial composition. Results: The circadian rhythm pathway was the most altered pathway by the WTF treatment, indicating that WTF is disruptive to the colonic circadian rhythm. Pathway analysis revealed interaction of WTF with alcohol in dysregulating pathways related to colon carcinogenesis. Similarly, the interaction of alcohol and WTF was detected at multiple parameters of the colonic microbiota including alpha- and beta-diversity, as well as the community structure. Our modelling revealed that almost a third of total gene alterations induced by our treatments could be related to alterations in the abundance of the microbial taxa. Conclusion: These data support the promoting effect of abnormal food timing alcohol-associated CRC related pathways in the colon, and suggests colon dysbiosis as a targetable mechanism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,047
Score d'incertitude au seuil0,631

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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