Sarcolambans are phospholamban- and sarcolipin-like regulators of the sarcoplasmic reticulum calcium pump SERCA
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT From insects to humans, calcium signaling is essential for life. An important part of this process is the sarco-endoplasmic reticulum calcium pump SERCA, which maintains low cytosolic calcium levels required for intracellular calcium homeostasis. In higher organisms, this is a tightly controlled system where SERCA interacts with tissuespecific regulatory subunits such as phospholamban in cardiac muscle and sarcolipin in skeletal muscle. With the recent discovery of the sarcolambans, the family of calcium pump regulatory subunits also appears to be ancient, spanning more than 550 million years of evolutionary divergence from insects to humans. This evolutionary divergence is reflected in the peptide sequences, which vary enormously from one another and range from vaguely phospholamban-like to vaguely sarcolipin-like. Here, our goal was to investigate select sarcolamban peptides for their ability to regulate calcium pump activity. For a side-by-side comparison of diverse sarcolamban peptides, we tested them against mammalian skeletal muscle SERCA1a. This allowed us to determine if the sarcolamban peptides mimic phospholamban and sarcolipin in their regulatory activities. Four sarcolamban peptides were chosen from different invertebrate species. Of these, we were able to express and purify sarcolamban peptides from bumble bee, water flea, and tadpole shrimp. Sarcolamban peptides were co-reconstituted into proteoliposomes with mammalian SERCA1a and the effect of each peptide on the apparent calcium affinity and maximal activity of SERCA was measured. While all peptides were super-inhibitors of SERCA, they exhibited either phospholamban-like or sarcolipin-like characteristics. Molecular modeling, protein-protein docking, and molecular dynamics simulations were used to reveal novel features of insect versus mammalian calcium pumps and the sarcolamban regulatory subunits.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».