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Enregistrement W3043721253 · doi:10.1101/2020.07.17.20155895

A phenome-wide association study identifying risk factors for pediatric post-concussion syndrome

2020· preprint· en· W3043721253 sur OpenAlexafffund
Aaron M. Yengo‐Kahn, Natalie Hibshman, Christopher M. Bonfield, Eric S. Torstenson, Katherine A. Gifford, Daniil Belikau, Lea K. Davis, Scott L. Zuckerman, Jessica Dennis

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Obstructive Pulmonary Disease (COPD) Research
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaBC Children's Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingCanadian Institutes of Health ResearchGeorgia Clinical and Translational Science AllianceNational Institutes of HealthVanderbilt University Medical CenterVanderbilt University
Mots-clésMedicineConcussionInternal medicineTraumatic brain injuryMigraineMedical recordPhysical therapyPediatricsInjury preventionPoison controlEmergency medicinePsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Objective To identify risk factors and generate hypotheses for pediatric post-concussion syndrome (PCS) using a phenome-wide association study (PheWAS). Methods A PheWAS (case-control) was conducted following the development and validation of a novel electronic health record-based algorithm that identified PCS cases and controls from an institutional database of >2.8 million patients. Cases were patients ages 5-18 with PCS codes or keywords identified by natural language processing of clinical notes. Controls were patients with mild traumatic brain injury (mTBI) codes only. Patients with moderate or severe brain injury were excluded. All patients used our healthcare system at least three times 180 days before their injury. Exposures included all pre-injury medical diagnoses assigned at least 180 days prior. Results The algorithm identified 274 pediatric PCS cases (156 females) and 1,096 controls that were age and sex matched to cases. Cases and controls both had a mean of >8 years of healthcare system use pre-injury. Of 202 pre-injury medical, four were associated with PCS after controlling for multiple testing: headache disorders (OR=5.3; 95%CI 2.8-10.1; P= 3.8e-7), sleep disorders (OR=3.1; 95%CI 1.8-5.2; P= 2.6e-5), gastritis/duodenitis (OR=3.6, 95%CI 1.8-7.0; P= 2.1e-4), and chronic pharyngitis (OR=3.3; 95%CI 1.8-6.3; P= 2.2e-4). Conclusions These results confirm the strong association of pre-injury headache disorders with PCS and provides evidence for the association of pre-injury sleep disorders with PCS. An association of PCS with prior chronic gastritis/duodenitis and pharyngitis was seen that suggests a role for chronic inflammation in PCS pathophysiology and risk. These factors should be considered during the management of pediatric mTBI cases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,322
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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