Diversity and Functions of Epilithic Riverine Biofilms
Notice bibliographique
Résumé
Abstract This article relates epilithic dry- and wet-seasonal bacterial biofilm composition to water quality along Río de la Sabana near Acapulco, Mexico. Samples were taken from various locations including nearly pristine upland locations, adjacent to residential floodplain developments, and immediately upstream from an estuarine lagoon. Bacterial composition was identified through sequential DNA analysis at the phylum, class, order, and family levels, with most of these categorized as heterotrophs, autotrophs, denitrifiers, nitrogen fixers, pathogens, and/or potential bioremediators based on generalized literature-sourced assignments. The results were interpreted in terms of location by extent of effluent pollution, and by dry versus wet seasonal changes pertaining to biofilm composition, related bacterial functions, and the following water quality parameters: temperature, pH, dissolved oxygen, biological and chemical oxygen demand, fecal and total bacteria counts, methylene blue active substances, electrical conductivity, and nitrite, nitrate, ammonium, sulfate, and phosphate concentrations. It was found that epilithic bacterial biofilm diversity was richest during the wet season, was more varied in abundance along the upland locations, and was dominated by Proteobacteria and Bacteroidetes with bioremediation and pathogen functions along effluent-receiving river locations. Low-abundance families associated with anaerobic and denitrifying functions were more prevalent during the wet season, while low-abundance families associated with aerobic, N 2 -fixing and pH-elevating functions were more prevalent during the dry season.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».