VizSciFlow: A Visually Guided Scripting Framework for Supporting Complex Scientific Data Analysis
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Scientific workflow management systems such as Galaxy, Taverna and Workspace, have been developed to automate scientific workflow management and are increasingly being used to accelerate the specification, execution, visualization, and monitoring of data-intensive tasks. For example, the popular bioinformatics platform Galaxy is installed on over 168 servers around the world and the social networking space myExperiment shares almost 4,000 Galaxy scientific workflows among its 10,665 members. Most of these systems offer graphical interfaces for composing workflows. However, while graphical languages are considered easier to use, graphical workflow models are more difficult to comprehend and maintain as they become larger and more complex. Text-based languages are considered harder to use but have the potential to provide a clean and concise expression of workflow even for large and complex workflows. A recent study showed that some scientists prefer script/text-based environments to perform complex scientific analysis with workflows. Unfortunately, such environments are unable to meet the needs of scientists who prefer graphical workflows. In order to address the needs of both types of scientists and at the same time to have script-based workflow models because of their underlying benefits, we propose a visually guided workflow modeling framework that combines interactive graphical user interface elements in an integrated development environment with the power of a domain-specific language to compose independently developed and loosely coupled services into workflows. Our domain-specific language provides scientists with a clean, concise, and abstract view of workflow to better support workflow modeling. As a proof of concept, we developed VizSciFlow, a generalized scientific workflow management system that can be customized for use in a variety of scientific domains. As a first use case, we configured and customized VizSciFlow for the bioinformatics domain. We conducted three user studies to assess its usability, expressiveness, efficiency, and flexibility. Results are promising, and in particular, our user studies show that VizSciFlow is more desirable for users to use than either Python or Galaxy for solving complex scientific problems.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,007 | 0,018 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,003 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,011 | 0,008 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle