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Enregistrement W3043958195 · doi:10.1101/2020.07.22.216333

CglB adhesins secreted at bacterial focal adhesions mediate gliding motility

2020· preprint· en· W3043958195 sur OpenAlexaff
Salim T. Islam, Lætitia My, Nicolas Y. Jolivet, Akeisha M. Belgrave, Betty Fleuchot, Gaël Brasseur, Laura M. Faure, Gaurav Sharma, David J. Lemon, Fares Saïdi, Jean-Bernard Fiche, Benjamin P. Bratton, Mitchell Singer, Anthony G. Garza, Marcelo Nöllmann, Joshua W. Shaevitz, Tâm Mignot

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiochemical and Structural Characterization
Établissements canadiensUniversité LavalPROTEOInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPeriplasmic spaceGliding motilitySecretionMotilityCell biologyBacterial adhesinMyxococcus xanthusAdhesionBacterial outer membraneBiologyBiofilmBiophysicsChemistryBacteriaBiochemistryEscherichia coli

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A bstract The predatory deltaproteobacterium Myxococcus xanthus uses a helically-trafficked motor at bacterial focal adhesion (bFA) sites to power gliding motility. Using TIRF and force microscopy, we herein identify the integrin αI-domain-like outer-membrane (OM) lipoprotein CglB as an essential substratum-coupling protein of the gliding motility complex. Similar to most known OM lipoproteins, CglB is anchored on the periplasmic side of the OM and thus a mechanism must exist to secrete it to the cell surface in order for it to interact with the underlying substratum. We reveal this process to be mediated by a predicted OM β-barrel structure of the gliding complex. This OM platform was found to regulate the conformational activation and secretion of CglB across the OM. These data suggest that the gliding complex promotes surface exposure of CglB at bFAs, thus explaining the manner by which forces exerted by inner-membrane motors are transduced across the cell envelope to the substratum; they also uncover a novel protein secretion mechanism, highlighting the ubiquitous connection between secretion and bacterial motility.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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