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Enregistrement W3044494211 · doi:10.1101/2020.07.24.220293

LIN-10 can promote LET-23 EGFR signaling and trafficking independently of LIN-2 and LIN-7

2020· preprint· en· W3044494211 sur OpenAlexafffund
Kimberley D. Gauthier, Christian E. Rocheleau

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesH2020 European Research CouncilNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institutes of HealthMcGill University Health Centre
Mots-clésEndosomePDZ domainCell biologyScaffold proteinBiologyEpidermal growth factor receptorGolgi apparatusSignal transductionFunction (biology)ReceptorGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract During C. elegans larval development, an inductive signal mediated by LET-23 EGFR (Epidermal Growth Factor Receptor) specifies three of six vulva precursor cells (VPCs) to adopt vulval cell fates. An evolutionarily conserved complex consisting of PDZ domain-containing scaffold proteins LIN-2 (CASK), LIN-7 (Lin7 or Veli), and LIN-10 (APBA1 or Mint1) (LIN-2/7/10) mediates basolateral LET-23 EGFR localization in the VPCs to permit signal transmission and development of the vulva. We recently found that the LIN-2/7/10 complex likely forms at Golgi ministacks or recycling endosomes; however, the mechanism through which the complex targets the receptor to the basolateral membrane remains unknown. Here we found that overexpression of LIN-10 or LIN-7 can compensate for loss of their complex components by promoting LET-23 EGFR signaling through previously unknown complex-independent and receptor-dependent pathways. In particular, LIN-10 can independently promote basolateral LET-23 EGFR localization, and its complex-independent function uniquely requires its PDZ domains that also regulate its localization to Golgi ministacks and recycling endosomes. These studies point to a novel complex-independent function for LIN-7 and LIN-10 that broadens our understanding of how this complex regulates targeted sorting of membrane proteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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