‘Big Data’ in animal health research – opportunities and challenges
Notice bibliographique
Résumé
Automated systems for high-input data collection and data storage have led to exponential growth in the availability of information. Such datasets and the tools applied to them have been referred to as 'big data'. Starting with a systematic review of the terms 'informatics, bioinformatics and big data' in animal health this special issue of AHRR illustrates some big-data applications with papers on how the use of various omics methods may be used to facilitate the development of improved diagnostics, therapeutics, and vaccines for foodborne pathogens in poultry and on how a better understanding of rumen microbiota could lead to improved feed absorption while minimizing methane production. Other papers in this issue cover the use of big data modeling in dairy cattle for more effective disease interventions and machine learning tools for livestock breeding. The final two reviews describe the use of big data in better vector-borne pathogen forecasts with canine seroprevalence maps and modeling approaches to understand the transmission of avian influenza virus. Although a lot of technical and ethical issues remain with the use of big data, these reviews illustrate the tremendous potential that big-data systems have to revolutionize animal health research.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,010 | 0,010 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,006 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,003 |
| Communication savante | 0,004 | 0,007 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,004 | 0,007 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».